Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr2_0616400

Sequence Length

2023 nt

GC Content

0.4642

GAGUUCGAGACCAGCCUGGCCAACACAGUGAAACCCUGUCUCUACUAAAAAUACAAAAAGUUAGCCGGACAUGGUAAUGGGUGCCUGUAAUCCCACCUACCUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGACGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAAUCGCACCACUGCACUCCAGCCAGGGAAACAAGAGCGAAAUUCCAUCUCCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACACCAAGAUCCAAAAUGUGACACUUAUUCAAAAAGUAUCUAGUGUUUUCAAACUGUACGUUUUCCAAGGACAGAAAGACUUUUCACAUUUUGGAUUUUACUUAAAUGAUUGUUUGACUGCCUCUCUCACUGGGCUGUAAAGCCUAUGAAGACAGAACAAUAUGUGUUUUGCUCAACCACCAGGGCUAGUCCAGCACCUGGCACAAGGCAAUCAUUAAACAUUUGCUGGGUUUAAAUUUUUUUAAAGACAAAAGACCCACAGACAGAACUCACUGACAUGUCUAUUCAAAACGCACAAAGAUGGCUGGUAUGGUAGCUGAUACCUGUAAUCUCAAGCAUUUUGGGAGGCCAAGGUGGGAGGAUUGCUUGAGGCUAGGAGUUCUAAACCAGCCUAGGUAACAUAGCGAGAUCCCCUCUUAAAAUAACUUUUUAGGCCAGGCGCGGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGACAGACGGAUCACAAGGUCAGGAGAUCGAGACCAUCCUGGCUAACAUGGUAAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCUGGGCAUGGUGGCGGGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCUGGAGGCUGAGGCAGAAGAAUGGCAUGAACCCGGGAGGCAGAGCUUGCAUGGAGCUGAGAUCACGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCGACAAAGCAAGACUCCAUCUCAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAUAUAACUUUGUAAAAAUCAGCUGGAGCCCAGGCACAGUGGCUCAGAUCUCUAAUCCCAGCACUUUGAGAAGCCAAGGCGGGAGGAUCACUUGAGCCCAGGAGUUCAAGACCAGGCUUAAGGCUUCACCUCUACAAUUUUUUUUCCUCCAAGACAGAGUCUUGCUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCAAUCUCGGCUCACUGAAACCUCUGCCUCCCGGGUUCAAGGGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUAUAGGCCCGCACCACCACACCCGGCUAAUUUUUAUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCUUGACCUCGUGAUCCACCUGCCUCAGCCUCCUAAAGUGUGGGGAUUACAGGCAAGAGCCACCGCGCCCGGCCUCUAUGAAAAAAUUUUAAAAAGUAAAAUGCAAUAAAAAUUGGCUUGGUGUGAUGGGCCGCGCGUAUAGCCCCAGUUACUUAGGAGGCUGAAGCCCGAGAAUCACUUUAGCUCAGGAGUUCUAGGCUGCAGCAAGCUGCCUGCAUGACAGAGCAAGACCCUGUAUCUAAAAAGAAAACCCAAUUUAAAAGAUGAAAUUUUGCAAUCAAAAUUUACCUACUUACAUAGUAAUAGCAAUCAUAAAAGCCACCAUUCACUGAGAGCCUACUUAAUGCAUGCCAGGUAUUAUAUUUAGAUUUUUCAUGGAUACAAUAACCACAGGACAUACUUUACAGAUAAGGAUAGUUAGGCUCCAAAAGGCUAACCUGUCUAAAGUUACAUGUAACAAGUAACUUUUUUUUCUUUUUUUGGAAUGGAGUCUCACUCUGUCACCCAGACUGGAGUGCAGUGGUGCAACCUCAGCUCACUGCAACCUCCACCUCCCAGGUUCAAGAGAUUCUGAUGCCACAGCCUCCCGCGUAGCUGGGAUUACAGGUGCCCACCACCAACAUCCGGCUAAUUUUGGUAUUUUUGGUAGAGAUGGAGAUUCUCCAUGUUGCCCAGGCUGGUCCUGACUCUUGACCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-991.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1018.36

Frequency: 0.0000

Diversity: 310.31

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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