Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr3_0115600
Sequence Length
267 nt
GC Content
0.6292
GCCUCUAGAAGACAGUGAGCUGGUGAGACCCUGUCCUUCAGACUGUCCUGAGCAGCUGCAGUGACAGUGGGGGAGGGCAAGGGACUCUUCAGCACUCCCUUCCAGCCCCUGUGCACCCAGUACCUCGGGGAAGUUGCAGUUGGGCCAGGGGCUGCCACAGAAGCCCUGCUCAUCGCCCAGGCUGUAGUUGACGGCCGACUCCGCCACGUGACACGCGUUGACCUGGCUCGCGCUGAUGUUGUGCUCCUGUGCCAAGCAGCCCAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-104.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -108.02
Frequency: 0.0046
Diversity: 32.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((((..(((..(((((.(((.(((((((((((..(((((((((........))).))))))...))))))).)))).))).))))))))..)))).))((((.((((.....))))...))))...........))))(..((((((((((((.(((.(.(((((.(((...((((((.....))))))......((((.(((((....))).)).))))..))).))).)).).))).)))))....)))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({{.((((..(((..(((((.(((.(((((((((((..(((((((((.,......))).))))))...)))))))}}))).))).))))))))..)))).}}((((.((((.....))))...))))...........))))(..((((((((((((.(((.{.(((((.(((...((((((.....)))))),.....((((.((({{....))}.}).))))..))).))).)).).))).)))))....)))))))....)
Back