Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr3_0288900
Sequence Length
442 nt
GC Content
0.4140
GUUUUGGUUUUUAGAGAAAUACUAGGAUUGUAAGUAGAUGAACGUUUAAAAGUAGGGCCUGGUAUCAGCCUUGUGCUCUCAGUAACCCCUUCCCAGUGCCAAUUUGGAGCCCAAAAUGCAAGCAUGAAAACGUGGCAGACCCUUCGACACCGAAUUUCCAAGCUGCUUUCAGCAAAGUUGUCUGAAAGGGAAUCUCCUCACAGCUGAAUUUGCAAUGGAGUUUGGUGGUGCAAUCGGUAUUGAUUAGUUUGGCAUAGACAGAUGCAGCAGUUUAGAGCAAAAUCGAGAAAAUGAUUUUUUUUUUCCUCCUUGAUUUCCUGGCAGAAGAUAUCUUACUUUUUCAGCAAACUUUUCUUUUAACACUAAAGCAGCCUAGGGCAAUGCCAGAUACUUAGAGCUUUUCUCUUGAUUAUAAGUAGAAAUGGGGGUGUCUGGGCUAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-104.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -114.60
Frequency: 0.0000
Diversity: 111.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((.(((((((..((((((...((((.((...............((((((.((....))))))))((((((..........((((.(((....))).)))).......(((..((((......(((.(((((...((((.((((((((.(((((((.(.....(((((.(((.(((..((((....))))..))).))).)))))...).))))))).)))....))))).))))...))))).)))......)))).)))....)))))).....(((((((.......))))))))).))))...))))))..(((((.........)))))........))))))).)).))))))))((((((((.((.(.(((..(((((((((.....)))).......)))))....))).).))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.{{.(((((((..{((((,,,.(((({(({{....,,,,....,|{((({|{(,,..}})))}}}{(({{{.,,......{{{{{.{{{,,,.,|},||}|,,,|{{.(((..((((......(((.(((((...((((.((((((((.(((((((.(.,...(((((.{{{.(((..((({....})))..))).,,,.))))).,.).))))))).)))....))))).))))...))))).)))......)))).))).}}},),)),,{{{{((({{{{.,,....,}})}},,,.)))),,,)})))},,||||,......,}})}}}}.},.....))))))).}}.))))))))(((((({({((.{.(((..((((((,,,....,|,|,.}....))))))....))).).))))))))))....
Back