Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr3_0291200
Sequence Length
329 nt
GC Content
0.5106
CCUGUUGGUAUUGGAAAAUACCAGUGUUAAAGACUGCGGUGGCACCGUUGGUUUUUUCAAGAGCAGGCCUCUUUGGUAAUGGGGGAAGUACAGCUUGAGGAAUUCCCAGGUCAAAGGUUGCCUCGAGGGGUCGCUUCAGUGAUUUGACAGCCGACUGAGUCAUGGCAGCUGCGGUGGCUGCAGCCUGUGCAGCUGCAGCCUGGUUGACCUGGUAUUGGGCAGCCUUGAUCUUGGCUUGCAAAUGUGCAGGGGGAUGAAAGUAUUUGCACUUUUCCCGAGAGCAUCUCCCUUUGAUGUAAUCCAUACACACAGUGACUGUGUUGUCAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-115.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -121.54
Frequency: 0.0001
Diversity: 121.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((....)))))))..........((((.(((((.(.(((((((...((((((((.((((((((.((((((..(((((...(.......)...))))).........))))))..)))))))))))).......)))).))))))).).))))).))))((((((...))))))((((((((..(((((((.(((((.(((......))))))))........))).))))..))))))))((((..(((((......)))))))))((..(((((.......)))))..))...)))..(((((((......)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((((....))))))),.,..,,{(,((((,(({{{,|,|{{{|||,||(((,({({.{{((((({.{{,,,{|||||{{.....,||||.||...,)|}||||{...{||||||,,||}}||||||||,,,,,,.}})).))))))),,.}))}}.||||||(({,.((({{{{|||..|}}})))))}|||.{{|||.||||}}..,}))))))),,,,,,,.))|{{||{....))))))((((..(((((......)))))))))((..(((((.......)))))..))...}}}..(((((((......)))))))
Back