Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr3_0367300
Sequence Length
564 nt
GC Content
0.4078
AGCCUGGAAGCAACUUUCAGAGACAGUGGUCCAGGAAUGCAGGGUUUAGCUUUCAAAAUAUAAGACGGGUUUAAGCAAAGGAAGCCACUUCUGGCUUAAAGAAGAAAUGUAGGGAGCUGGGGUGAGGGGAAUGGAGCAUGAAGGGAAGGGAAAAGGCUGCCAGAUGGAGAGUAGAGAGAUGCCUACUUUGAGAGGCAGCUAUCUCAGAUGAGAGGUGAUCCUAUAAUAACAGGAGUCCUAAAGAUGAGAGAGACAAGAAUAUUCAAGUCAUAAGGGUUACCAUUAUAUUAAAGUGUUAAGAACUAAAGCAAGGGUAUUUUUAAUAUUUAAUAAUGGAAAUUAAAAUGCCCAUUUUACAAAGUGAACAUGGAAAUUCAGGGAAAACUAAAAGGAAAUAGUAAGUAACAAAGCCCAAUUCUAAGCCAAGUACUAUAUGUCUAAUACUAAAGCCCCAACUGUUCUCGGCUCACAUCACACCAUUAGCUCCAAGGGAGUGCAAGAAGACAGAGAUCCCAUAUUUCUCAGAGUGUACUAUGGGCCUCUGUCAUGCCUGUUUUCCUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-139.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -150.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((...))))))).(((....)))((((((.(((((.....((((((....((((.......(((((((...(((((...))))).))))))).......)))).((((((((((((..((.....((((..(((.((..(((....(((((((......(((((((........)))))))....))))))).(((((..(...(((...((((........))))..)))..)..)))))..(((..((....))..)))....(((((.(((((((....((((((((((((((........)))..))))))))))).)))))))............(((((((((...))))).)))).............((((........)))).........)))))........((..((((.((......)).))))...)))))..)).)))...))))...)).)))).))))))))..)))))).......(((((((..((((((...(.......)...)))))).)))))))...))))).))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,(((((((...))))))).{{{....}))((((((.(((((,{{,,((((((....,,,,...,...(((((((...{{(((...}})}).)))))}}...,...,,},.((((((({((((..{,..,((((((..(((.((..(((....(((((((...,..(((((((........)))))))....))))))).(((((..{...(((...((((........))))..)))..,..)))))..(((..((....))..)))....(((({.(((({{{.,{,{(((((((((((((........}}|.,)))))))))))})))))))..,,,..,||,.(((((((((...))))).})))..,},..{,,...{(({........}}}}.........,})))........{|..{{{{,|,....,.)}.))))...,,)))..)).)))...)))).)))).)))).})))))))..}})}}}.,.....(((((((..((((((...{.......)...)))))).)))))))...))))).))))))...
Back