Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr3_0368900
Sequence Length
593 nt
GC Content
0.5008
GUAUAGGUUUCUGAGAAGGGCCCUUCUCCAGCCUCGCUUGCUGCCUGGAUUCUGAAGGAGUAGCAUGUGAAUUCCGUCAGUCUCUGGACCUUGUAGGUGUGGCUGGGUCCUCUGUAGAUUGAAAUAAACCUCUUGUUUCUGUCCUCCAGCUGUAGUGUGUACACAAUGUCCUCAGCAGCAUGUGUCUUGGAGUUACUGUCUCCCCAUUUUAGCUUCAGGCUCUGAGGACCAGCAGCAGCACAUUCUAGCCUAGGAGGCAAGGGUGGUAAUGGCCGAGUUUUUGCUUUAAUGAACUGACUAAAUGGUCCAGCUCCAAUUUCAUUUAUAGCCUGAAUUCUGAUCCGGUAGGUGGUUUCUGGAAGGAGAUCUUUCAUAACAUGCAUGGUGGUGUUGCCCACGGUAAUGCUAGUGUCUCCUAGAUCAAUGGUGUAAGCAAGGAUUUCAGAUCCGUUAUUGCACGGCUCUUCCCAGUUCAGUACAAGGCACGCAGAAGGUGAAUCAGGGUAGGCAUCAAGGGGCUCCUCCUCCAGGACACAGAGAGUGGAGACGGGGUCAGGGGCAGACGCUGGCGUCUGGCAAAGGACAAGUUCACU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-186.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -196.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((.((((....)))).)))...((((((.(((((((.(.(((((..((((.(((((.........))))).))))..))))).)...))))))).))))))(((((((((((((.(((((..(((.((((.......(((((.((((.(((((((.......((((((((.(((.......(((((((((.((......))...))))))))))))))))))))........))))))).))))...))))))))))))((...((((((((((....(......)....))))...))).)))...)).)))))))))))))(((((.(((((.((((.(...((..(((((((.((((..............((((..((((((((((...))))))))))))))(((((.(((.....((((((....(((((...)))))....)))))).((.((.(((.(((((.(...............).)))))..))).))))))).)))))...)))))))))))..))...).))))..))))))))))(.((((((....)))))).)..))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((,,,{{,(({((|,,|}}}}}((((((.(((((((.{.(((((..((((.(((((.........))))).))))..))))).,...))))))).))))))((((((((((((,,(((((..,{(.((((,......(((((.((((.(((((((......,((((((((.(((......,(((((((((.,(......,)...)))))))))))))))))))).,......))))))).))))...)))))))))))|((...{{|||(((((...,|,.....||,,,||||...})),))),..)}.)))))))))))))((((,{(((((.((((.(...((..(((((({(((((.,,...........,.{{,.((((((((((...)))))))))),}||({{{{.{{{.....((((((....(((((...)))))....)))))).((.({.(({.(((({.,....,.....,....}.))))),.))).))))}}}.)))))).})),)))))))),.)}...}.))))..))))))))))(.((((((....)))))).)..}))))..,...,}}
Back