Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr3_0375700

Sequence Length

469 nt

GC Content

0.3156

GUUUAAUUAUUUCUGAAAGGCAAAACUCCAGUAAUCAAAUAGCUUGUAUGGAAGAUAAAAUAACAGUUCAAAAUUAAGUCAUUCUUUAAAAUAUUCCUUUUCUACAGGGUGAAAAGAUGUUCUUGAUAGUAACUAAACAAGAUCAGGUGUUAUGGACUUGAGAAAUACAUAAAUCAUAAGAUCUAUUCUAAAUCUCUACAAUUGAAAAACCCCACGAUGUUUUCAAGGAUUGUAGGACUCUUAAAAUGAAAUUUUACACUUUAUUAUAAUUUAGAAAAGAAAAACACACAAGUCUGAACCACACAACCUUUCAGAGAUAAAGUUCAAAACUACAGCAAACUCUACAGUCGCAUUUGAAUUGUAAGUUACUGGAACACGCGUCAGCUACCAUCAAAGCUCAAAGGCCCUGAAAUCCAGUUUGCUUAAUGGGAUAAAAUUAAACUUGAAUAUGUUCUAAUUGACUUCACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-72.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -85.35

Frequency: 0.0000

Diversity: 113.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((((((((((........(((..........((((((.(((((((...........................))))).........((((((........))))))....(((((.(((...)))..)))))((((((.......))))))....................(((.((((((((.(((((((((..(((((........)))))....)))))))))........((((((.........))))))...)))))))).)))....)).)))))))))..........))))))))))))).(((((((((((..((......))..)))....)))))))).(((((.((((((.((.(.(((((((........))))....)))).))...))))))..)))))..........)))))))(((((...(((......)))))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((((((((((((......((((.....{,,.....})}..)))).,.............,.....,,,,{....,||,,,........((((((........)))))).{(.(((((.({{...}}}..))))).)},((({,.,(((((((.............{{....}}|((.((((((((.{((((((((({(((((........)))))),..,)))))))).....,{,((({{,.........}}}}}}...)))))))).))}........)))))))},}.,}).,..))))))))))))),{(({,..,}||..{(,.{{{{.{{{{(({,..,,})}}))}|||||,((((((.{{.(,,(,((((........))))....}))..))...)))))).,)))}}.,|,|,,...}})))))({{{{...{{|,.....)))}}}}..)