Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr3_0375900
Sequence Length
1281 nt
GC Content
0.3677
UCUGUGUUGUUAAGCCUGUAGAAUAGUUUAUCCUAUAGCCAAUACUUAAGAAUACCUUGGAUCAAUAAAUGUCUUACAAAAAUAUAUGCAAAAUUUUGUGGUGUAGUUUAAAUGGACAUUUUUCAGGAAAGGAGGAGAGCAAUACAUUUUGCAACAUAGUUGAAUAACGUAAUAAAAACCCUGAAUGUAGAGUUGUAGAAUAUUUAUGUUAUCUCCACAACUCCAAUUGUACACAGUGCAUAUCACUCAGUUGGGAUUACUCUGAUUUAUAACCACCUAGCCCACUUUGUAUAGUAGAUAAAUAGUCAGUUAGUAAAUAUAUAUUGCAGAUCUACCAAUGCUAUAUUAGGUGCUGAAGGUACAGCAGUGGUAAUCAGAUUUAGAAACAUUAGUGAACAAGACAUAUGACUGCCCUCAAGAAACUUCGUUUCUAGUGGAAAGAAACUAAAUAAUCUCACACAUGAGAAAAUCAAUCAUAUAAUAACAGGAACAUAAAAAUGCCACCAAAAAUAUGAUAAAGGGCAAUGAGUGGGGCAAGAAAAUGAUAGUGUGGGAGGGAGUUGAUAGGGUGCUCAGUGAAGAUCUGGGCAUUCUUGGUCUGAGUAAAAAAUGCACUAAAAAAGGAAUUGGAAAGUAUUAUCUCAAGAUAAUUUCUCACCCAUGCCAUGCAAUCUUGGGUAAUGUCACAUACCCUGUCUGAAUCUCAAUUUUCUCAUCUUUUAAAAGAGAUUCUAUACUCAUCUUUAUAUACUUCAAAGAACGAUUACACUUUGAAGUUUUAGUAUUAAGGUAUUCACCUUCCUUGAAAAUCAAUUGCAUUUUUGUUCUGUGAUCAAUAUUAUCCCUCGGUUUGCACAGCACCAAACUGUCAACUUUUUCUGAUAUAAUAAUUCUUGUCUUGUCAUUCUCUCCUUCCCAGAGCUCCCUUCCCCAAUCAACCACUCUUCAUUGAUUAGAAAGGGAGGUGGCAGAUAGGAGUGAAGGGCAAAGAGGAGAGAUUUGGAAGAGAUCCCCAGUGUUGAGACUACUCAAAAAUAUCCAGGUGAACUCACUCCCUAUUUUCCCUGAAGCCCCAAAUUGGUGAUACAUAAACUAGAUUGUACUUAGCCCAAGGCAUCCAAGAAGAGACAAUUACUUUACCUAAAGACAACUGUAAGUGUAAACGUGCACAUCUUACAAAAGUGGUUACAAUCCAUUUCCACGAUGCUGACACUGCCACAGACCCCAGCCCUAGAAACAUGUGAACACAAUUAAGCCAAUCUUCUCUCUGUCUCUAGACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-294.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -320.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 266.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.(((((.((((((.(((...))).))))))......))))).)))))(((((((....((((((((........(((((((((....)))).)))))........))))))))((((((((((((((((.((((......))))......(((....)))...........((((.((((.(((((((.(((((.......))).)).)))))))....(((((...))))).......((.(.((((((..(((((((....(((((((.((((((((.((((((((......(((((.((.((((......)))))).)).)))....)))))))).))))).....)))..))..))))))))))))........(((..((.......))..)))..((((((..((((((...))))))(((........)))......(((((....)))))......(((((((.......((..(((....))))).......)))))))..))))))((((..((((((((((....((.((((.(((((((((((((((((((((..(((.(((((.(((.....((((((..((..(((((((((......((((((..((..((.((((((....))))))..))..))..(((...))).....(((((........))))).....(((((((....................))))))).......(((((.(((((((((((((..........)))))))))....)))).))))).......))))))..........)))))))))...))..))))))......)))..))))).)))))))))...))))))))))))))).)))).))..)))))))))).))))(((((((((.........(((((((((.(((..((((.((((.((.......)).))))))))..))).)).).))))))....))))))))).........)))))).).))(((((....)))))..)))).))))....))).))))....))).))))))....(((.(((((.........))))).)))......(((...))))))))))...)))((....((((....)))).....(((((((((........))).)))))).((((((.......)))))).......((((...(((...)))....)))).(((((.(((.(.(((................))).)..))).)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({(({((,{(((((.{((,.,|||.}}}}}},,,,..,}|||.,,,,,((((({{....{(((((((....,{,.(((((((((....)))),})))).,},....)))))))}(((((((((({(((((.((((......))))..,...|||,...,,,.,........,{(((.{{{{.(((((((.(({{(.....,.}}),)}.)))))))....(((((...))))}..,{{{{{{|{|{{{,{{..(((((((....(((((,,.,{,,((((.((((((((......{{(((.({,((((......)))))).)),}}}....)))))))).))))|{{{..,,,.}))}.))))))))))))........{{{..||,......,}..,}}..((((((..,(((((...)))))|{((........))}......(((((....)))))......(((((((.......((..(({....})))).......)))))))..))))))((((.,((((((((((....{(.((((.(((((((((((((((((((((..(((.{((((.(((.,,..((((((..((..(((((((((......{{(({,.,((,.{{.((((((....))))))..)}..,},,{({...})}.....(((((.,,...,,))))).,,..(((((((...,.............,..))))))).,,,...,,,,,.{{{,(((((((((..........)))))))))....)}}}.|||||....,,,)))))),.........)))))))))...))..))))))......)))..))))}.)))))))))...))))))))))))))).)))).})..)))))))))),))))(((((((((,.....,,.(((((((((.(((..((((.((((.{(......,},,))))))))..))).)).).))))))....)))))))))...{{..,.|,}}}},},||(((((....))))}..}))}.}})).},.))).))))....)))})))))),.,,,,.,|||||,,||,|,,,}}},,.,}}}},,,.(((...)))}}))}})..|||,,,....||||....,,}}.....(((((((((.....,,,))}.)))))).,{((((.......)}})}},.,,...||||,,,,,|.,})))}...|||,.(((((.(((.(.((,................,}}.)..))).))))).,))
Back