Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr3_0498600
Sequence Length
407 nt
GC Content
0.4324
UAAGGAUCCCAGUUGAGAACGGCUAGCAAAGGGUUCACAUGGAAGAGAAUUAUGAAGUUUUUUCAGGAGGCAUCCAGAGAUGAGAAAAUCGAGAAGAGAGGUUAUGCGGCACGUGCAAGGUCUCCAAGUUCGUCAGCAGCAUAACUGGUUUGGGCCUGCCUUCCGACUGCAAAGCCUGUGUUCUUUCCACAAUGCUAGACCCUCAUUUGAAACCAUCUUUCAGCCUCCAAACCUUGCUUUGGGAGCUUCUUUUUUUUCACCCUCUUCAGUGAUUUAUUCACCAUCUGUGAUUUAUUCACCAUCUCUCUUAUAGAUCAAGAUCCAACACUAAUUUGACAUUUAAUCAAGACUCUCUACAAGUUGACUAUCUCUUACUGGCUGUGUGACUUCUACGGAAGGCAAACUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-85.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -94.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 117.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((((....((((((((...(((((......(((((((((....(((((((.....((((((....(((((((........(((((.(.(((((.(((((..((.(.(((((.((((((....((((........))))))))))...)))))))).))))).))))).).)))))..((.((((.........))))))....)))))))..))))))...((.......))))))))))))))))))))))).....((((.....)))).((((.((((((((..............)))))))))))).......(((((((.....................)))))))...........)))))))).((.((((....)))).))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........(((((,...((((((((..,(((({{,,,.,((,(((((,...,(((({,......((((((....(((((((.{......(((((.(.(((((.(((((,.,{.({{{((({(((((({,.,({,,..,...,})))),,,)))))))),,..,).))))).))))).).))))).....,,,{...,....,},,}|||...)))))))..))))))...,{....,,,)))}))))),},,}}}}},,,)}.....((((.....)))).{(((.((((((((..............)))))))))))}...........{{{{.......}}}}},.}}},,.,,,))}),...,))}},.)))))))).{{.((((....)))).)}})))).
Back