Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr3_0745600
Sequence Length
1517 nt
GC Content
0.5089
GUGGAAGGACAACUUGUGCCCAGAGGUCAAGACUGCAGUGAGCUAUGAUUGCACCACUGCACUCCAACCUGGGCAAAAGAGUGAGACCCUGUCUCAAAAACACAAACAAAAACCAAAGUUACAAUUAGAAUGUAAGUACCUACUUCCUUUUGUUUUUGCUUAAGUAUGUCUUCUUCAUACUGUUUCUGCAUCUCUUCACGUUCCUGUGCUAAGCGAAGCUCCUCUUCUUGUUCUUCCUUCUUUCUUUGCUCUUCCUCCAGUUGUUUCUUCCUGCGCUUCUCUUCUACCUGGGCAGUGAUGGCUUUCUAGUCAUAAGCAAUCACGUAAAUCAUUGUCAAAAAUAAAAAUCUAAGCAGGAGGGAAUUCAAGAUGGCUGACUAGAUACAUUCAGUGCUCACCUCUUCCACAGAGGGGAACCAAAAUAAUGAGUAGACAAUCAUACUUCACGUAGAUCUAACAGAGAACAGUGGAAUUCAACAUGACAGGAAGCAUCAAAAGCAAGGAAGAAAGCAAAGCAGCCUGUCUUGACAGGAUUAGCUAGGAGUCUACAGAGGCUGCCUAAUUGGAGGAAAAGGAAAGUGAGCAAUCCCCAGCAAUCCACAUGCCCAUCAAGGACUCCUACAAUCCUAACCAUCAAACAGCCCCUUGACUCUUGUGGGUCUCAAGACUAACAGGGCGUUACCUGGAGACCACAUGAAAGCACUGCUCAAGAGGGAGCUCACACUAGGCUCCACAAACACCCAAGACCUAAGGAACUGUAGCAUGGCACUAUUUUGAGAGCCCAGUCCCUAGUGGUCCUGCAUCUUGCUCUGGGGCCCAACAGCCCCUGCAUCUCCACAUCCCUAGAGCCCCACUGACAUUCACCAUCUGCAAGAGCAACCCACUGAAAGCAAACCCACCCUCCCUAGUAGCAGAGCUACAAUGCAGCUGCUACUGCCCCAACCUAAGCAUUCUGCUGGUGGCCUGGGAAAUCAUCCCACCCCUGCCUACAACAGCCAGCACUGCACACAACACCUUGGGAACCCGGGGGCAGGUCUGCCCAGCCUUGCUGCAUCUCCACCAGUAACCAAGCACAUUGGUCCAGGGACCUGGGGACUGCCCUGCCCAGGACACCACCAUUGGCACCUGAGCACUCCUCCUAGAGUAUGGGCCCAAUCAACCUGCCAUUACCAUCACAGCUGGCACCCACCCUCAUAUGCCACCUGCAAGUCUGGGGACUGGCCCACGCAGCCCAUUAUAGCCACCGCCAACACCACCACUGGCUGCUUGGAUCCCAGAGGGUUGUCCCACUACUACUACUGCCAUUGCCCAUGUUUGCUGCCCAGUGGCUUGAAAACCUACUCACCCACCCAACCCACUGUCACCAUUCUCAGCACCUGAGCAAGCCAUCUAGAAGCCCAAUAAUUGGCCUGGCUUGACCUGCUACCACUGAUGCCAGUGUAUACAGCCCUGGGGCCCAAGGACAGGCAUGCUCAGCCUACUGCUAGCAUCCUGCAACCUAACGACUGGUCCAUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-442.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -467.60
Frequency: 0.0000
Diversity: 304.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((..(((.(((((((.(.....((.(((((((.((.......))..))))))).))...)))))))).)))..((((((...))))))..........(((((((.((((.........(((.(((......)))))))))).)))))))....((((((.......))))))......((.((((...........((((((.((..((.((((..((((((((((((((((((...((((..((((.((((((....((((.((..(((((((((((.((((((.(((((....((((((((...((.(((.......((.((((.................))))..))........))).))))))))))..)).))).))))))(((((.....)))))..............(((((........)))))...)))))......))))))..))))))..)))).))..))))))))...)))).))))))))).((......))((((.((((.((((((.(.(((((((((.....(((......((((..((....(((..........)))))..))))......)))......)))))))))))))))).....))))))))...(((((((.(((((((((((........((((......)))))))))).))))).))......)))))..((((((.......)))))).........)))))....)))).))...)).))))))......))))))...)))).((((((...(((.((((((...(((((......))))).((.(((..........)))))....................)))))))))..)))))).........))))(.....(((((((((.((......))..)))))))))...........(((...((((((((((.(((((.....))))).....))).......))))))).)))........(((((((..((((((((((((((.(((((((...)))).........((((((.((.(((...((((...((.....((((((.(((((((.((((...(((....)))..)))).)).....((((((((((..(((...........)))..))).....(((.(((((............))))).)))....))))))).((((.(((.((((((............................)))))).)))...))))))))).))))).).....))...)))).)))...)).))))))..((((((.(((..................))).))))))........(((((...)))))...((((..((.........))..))))..)))..)))))))...(((((....))))).......))))))).))))))).((((.(((((.(((.....))))))))))))..(((........)))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,.({{{..(((.(((((({.({{...((.(((((((.((.......))..))))))).))..})))))))).}})..{(((((...)))))}........,,((((({{.{((({{{{,....,..,|||}.....,}}}},}))),))))})}.,,.((((((.......)))))),,....||..((({,{{.......((((((.((..((.((((..((((((((((((((((((...((((.,((((.((((((....((((.((..(((((((((((.((((((.(((,{,...((((((({..,((.(((..,....{{.{({{.................}}}}}},,.....,..))).))))))))))..),.))).))))))((((({....,))))}}...........,(((((........))))},,.)))))......))))))..)}))))..)))).))..))))))))...)))).))))))))).{{..,({,{{((((.{{{|,|||{{{.{.(((((((({..,{.(((((.....{(({,((,...(({..,....,..}}}}}.,},.,...,..))}......))))))))},}}))))..,,.}}}}})))},.||||}||||((((((((((........((((......)))))))))),))}},.|||..,))),,,}.|((((({.......)))))).........)))))....)))).))...)).)))))).....}))))).,||}||,.((((((...(((.((((((...(((((......))))).{{.{((..........})))}.....,{,....,.......)))))))))..)))))).........}}}}{.....(((((((((.((......))..)))))))))...........(((...((((((((((.(((((.....)))))..},.))).......))))))).)))........(((((((..((((((((((((((.(((((((,.,||||.........{{{{{(,((,{....,||||..,({....,|(((((.(((((((.((((...(({....}))..)))).)),,,,..{{,{||||{,,(({..........,|||,.},}.....{{{.|||||......,.....})))).}}),,.,))))))}.((((.(((.((((((.......,....................)))))).)))...))))))))).))))).......}}...|}}}.|||.|,}}.}}|||}..((((((.(((..................))).))))))........{{|||,,.)))})}}|{{{{..,,,..|,,.......,))).})))..)))))))...(((((....))))).......))))))).))))))).((((.(((((.(((.....))))))))))))..{{{........))),,....)
Back