Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr4_0183500

Sequence Length

2201 nt

GC Content

0.5239

AGAGCUUCAGUUUCACGUCACUGUCCUAGCUUCAUCUACCUGUUGCCAACAACUUGAAGGAGUUUCUCCAUAGCCCUUGAUUCCUGAAUUGUUCAACAUAUCAACAGCAAUAGUCACAAAUACAUUGACUUAAGGAGUAAACAAGCAGCUUUUCUCUACAGACCACUGAGCACCCCAGGAAGGUGCAGCUCUCUGCUCCACCCCAGCGUCUUGGUGUCUGUGUCCAGCAGGAAGGACCUGGCAGGAGGCUGAAUCCAAGCACUGCUUUCAGGCCACUCUAUUCUCAUCCCUGGAUCCUCCAGGGAAAUAAGGGGGAAAAAAAAUGACUUUUCCUGCUUUCAAAAUGGAGGGCCUUAAAAUCAACCAAAGUUCCAGAACAAAAACAAAACACAGGAGCUGGCUGGGUGCACUGGCUCACACCUGUGGUCCCAACAUUUUGGGAGGCCAAGGUGGGAGGACUGAUUGAGUGCAGGAGUUCAAGACCAGCUUGGCCAACAUGGCAAGACCCCAUCUCUACAAAAAAAGUAAACAAAAAUCAGUCGGGCAUCAUGGCAUAUGUCUGUAGUCCCAGCUACUCUGGAGGGUGAGGUGAGGACUGCUUGAGCCUGGGAGGGCAAGGCUGCAGUGAGCCGAGUUCAUGCCACUGGCACCCUAGCCUAGGAAACAGAGUUAGACCUUGUCUCAAAACAAAAACCCAAAAAACCCCCCAUCAUCUGCAAAGCCAUGUUGGGAGCACAACUGUUUCCCAUAGGCUUUCUUUUUCCUUGCCCCAUUGACUUCCAGAAGGUUUUCCCCUUACCCAUCAUUGUGACUUUUCUCAUCUUUCACAAUGGUGCAAUUCAAUAGGAAGAAUUAACAACUAGAAAAGGAAGAACAACAACAACAAAAAAUCUAACCCUAUGAAAACUCUGCCUUCAACAUAACUCCAGGGAGAUGAACAUUAUAAUACUGGCACUCCUGACCCACACUAUCCUCUGCACCCCGUCCCUGACCACAUCCUCCUCUCUGGACACUUAGACAUCAGGUUCCCCAAGGGACAAGGUUCCAUGAAGAGCACCCUGAGUUCCUUAGAAGAACUGGCACUGCUCCGGCUCCUCUAACAACUGAGACUGGCACUGUGGGCACCACCAGGUGAGCCUCUGGAACCCACCUGAGGGCCCAAAGGGCUUCUUCAUGACCUGGUGGCCAGCUGGGCACUGUUCUUUCUGGUAGACCUGCAUGUGCUGCGGUUUGCCCUGGAACUUGCCCUGCAGCCAGGCUGUACUGAACUCCACCACGUGAUCCACCAGGGCCUCCUAACAUGGAGGCACUCAGGACUGAACCAAGAGAAAGGGGAUGGAUGCCAGCUCUGUACAAGACUUCAUUCUUAAUGACGUUCCCUAGCCCUGAGAAGUAUUUCUGGUCCAAUGGUGUAUAAGUGACAGGCUGAGCCUGGCCUAGAGCUUCCAAGGCUUGUCCUCAAUGGAACUUCUCAGACAGGAUGUCACAGGUGGGUGUGACCUCUGGGGAAGAGCUCCAAGGCAUCUGACAAUUAUAAAGUGCCAGGAAGCUACCACCACCAAAGUACAGGACCAACCUCGGGGCAGGGUCCCUCCGGUCCCCCUUCUUGUUGGCUUUCUUGGCUCUGGAGAAGUCGUUCACCCAAACGCUGCCAAGCAAACAAGAGCUGACACGCAGCCGCCUCCCAGCAUCUCCUGUAGGGGUGUCUCCCUUCAAACAUUCCUAAUCAUCCUCUCCCUGGGGGACGAGCUCUGCGGACUGUGAGGAGGCGUCAAGGGUCUUCUGCCCACUUGCUCCCGGGCCUGCUUUGAGUCCACAGUCCCUUCCUUCUGCGCUUCUUUUUGUGGAGGCUCUGGCGGUGAGCUGUUGCCAGCGGGCCCCAUUUCUUCAUCUGGAUCAAAUCUAAGGAAUAAUUUCUUUCCAUGGACCUGGGUGUCCUGGAGCCACAGAGACUGGAGGCUGGUGGGCUAUACUUCUUACUGUUGCUCCCUGUCUUUACCACCUGCUUGCCCACAAAAGGAGAGACCGAAUGGUGAAAUGUCCUCACCAACAGCCCUUCUGGCAUCCCAGCUCCGGGUGGGCAGCCCCUUGGCCCGACCCAGCACCACUGCACGCCCCGCACAGCAGCUCCAGCACCAGGCAGAGAUUUCUCAGCGCCACGGCACACGUGGGCUCCGUCCCCUUAGGGGACGCCCCUGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-754.37 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -790.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 574.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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