Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr4_0191700
Sequence Length
694 nt
GC Content
0.3386
GACAUAAAUGGUAGGCUUCCAAGCCUACCAAGACAUUCAUACUCAGUAUAACUAUAUACCUACUCUAUACUGCUAACUUAAGUUUAGCAUUUUCUAAACUAACUGUCACUUAAAGAGAAAAAUCAAUACAUGAAAUAUUGGUUCUAAUAUUAGUCAACUAUUUUUAAACCUCUUCAAAGUAUUGGGAAAAUAUCAGUUUCCAGGAAUUAUAAAGUCAUGUUAUUGAUACAUUUUAAGAGUUGCAGUUAAAGUCAACAGGAUGUGUUUAGAAUUUAUAAAAUUAAUCUUAAAAUUUAGCCCACUGUAAUCCUUACUGUGAACAUCCCUGGAACUGAAACCUGGCACCCUUAUCUUCUUCUGAGCACUGUCUUUUAUGCUUACUACCCUCCCCUCAAUACCACCCCCAUGCCUACCUUGAAAACUCCAUGUUCUUACAUGACCCUGGGCUACAGUGAAUUAGUCCAACUUGACCCAGCCAUACCAAUGUUUUCAGUUGUUACCUAUUAUGACUAAAUCCAUAAGCAUUCUUUAAAAAAAGCCUUGCAAACAUGUUUUCAUUUCUAUUAGGGAAGUACUUUCUUCAACCACAAAAAAUGGAACUAGAAGUCGCUACAACAUGAAUUAACUUUGAAAAUAUUAUGCCAAAUGAAAUGAGAGGACAAUAAGACAAACACUGUAUGAUUCUAUUUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-120.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -134.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((((((....)))))))).(((...((((((.(((((((...............)))))))........(((((((......)))))))((((((.((((..((((....((((((((((((.....(((((((.........(((.((((((.((.....)).)))))))))(((((.......))))).))))))).....))))).)))))))...))))..)))).)))))).((((....(((((((((((((((......(((((........)))))....(((.((((...)))).)))......((.((........)).)).............)))))))))).)))))....)))).......(((.((((..............................(((((....)))))....(((((((........)))))))..........(.((((...((((((((((..((((....(((((........)))))(((..((((....))))...)))...((((((..((((((((.....((((......))))..(((.......)))...))))))).)....))))))...)))).)))))))))))))).)........)))).)))................)))))).))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((((((((....)))))))),{({...((((((.(((((((...............)))))))........{((((((......))))))|((((((.((((..{(((,...((((((((((((.....(((((((.....,,,.,,,,||,{,{.,,.....,,.}}}}}}|||((((........)))))}))))))).....))))),,))))))...))))..)))).)))))),{(({....(((((((((((((({......{,,,,........,,,},.,..(((.((({...}))).)))......{{.((........)).)).............}))))))))).})))}...,)))).......{{{.{(({.....................,|.......(((((....)))))...,(((({({.,,,....,,}}})}.,,,}.},}}}.,,,,..{((((((((((..((({....{((((........))))}(((..((((....))))...)))...{{((((,{{((((({,.,.{|{{((,,.,,,||},..(({.......)))...,}))))}.,,,..,})}))...}})).}))))))))))}}},,...,}...)))),))).....,}.........)))))).))},))))))..
Back