Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr4_0586100
Sequence Length
713 nt
GC Content
0.4123
GAAUGUGUGAGUACUAAGAGUACAGAUUUAUCAUACAUCAAAGAACACACUAUUGGUAACAGACUAUAUAGUCCCUUAAGAAAUAAAGGAGGUAUUCAUUAAGACAAGCAUGCAACAACAGUCUAGCAUCCAAAUUUGAAAAAAUAAAAACCAAAGAACUUCCAAAAUUGAAGGUUCUGUUAAAUAACAAAUCAACCAAACCUUCAAUGCAACACAUACCCACCAGCACAGCUACAAAUUUUUUUGAGACAGUCUCACUCUGUUGCCUGGGCUGGAGUGCACUGGCACAAUCUGGGCUCACUGUAACCUCCAGCUUCCGGGUUCAAGUGAUUCUCGUGCCUCAGCCUCCCAAGCAGAUGGGGACUACAAGUGCCCGCCACCACGCCCACUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACAAGGUUUUAUCAUGUUGGCCAGGCUGCUCUUGAACUUCUGGCCUCAAGUGAUCCGCCCGCCUUGGCCUCCCAAAAUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACUCUGCUUGGCCUAAACAAAUUUUUUUAAUGACCAACCAAAUGUUACAAAGAAUGCAGAAUACCUUGAACUCUUCUACUUCAAUUCAAUUACUGGUAAAUGGUAUGAAUACUUUGGAAGUCUGGUUGGUAGUUUCUAAUUGACUUGCAAGUGAGAAGAGGAAACUUCCUAGGGUGACGGAAAUAUUCUAUCUUGAUUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-170.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -185.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((...))))).......))))))))..........(((((((((.....)))).))))).((((........))))((((((((.......(((((((((.((....))...))))....((((....)))).....................((((((((((..(((............)))..))))))))))................(((...))).((((....)))).(((((.......)))))(((((((((((((((((.((((.((...)).)).)).))))..)))))))..))))))...((((...(((((((((.....(((((.(((...(((.(((...))).)))((......))..(((((...........))))).(((.((((((...(((((...(((((((...(....)....)))))))....)))))......))))))..)))......))))))))....))))))))).))))..)))))..........(((((((...((((.........)))).)))))))...))))))))....((((((((((...(((((..(((((.....))))))))))....((.(((((.((((((......))))))))))).))))).)))))))......))(((((..((.((((...)))).))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((((...))))).......)))))))}..........{{{{{{({{....,|||,.}}))),((((........)))){((({{((..,.,{.{,{({((((.,,....}}...))}}....,{{{,...,,,,....,,,,.,,..,,,,,,,.((((((((((..(((............)))..))))))))))......,,,,,,.,,,(({...|||.{{{{....}}}|||{{,{,,|||.,}||},(((((((((((((((((.((((.(,...,}.)).)).))))..)))))))..)))))).,,||||,..(((((((((.....((((,{(((..,{(({(,,.,,{{|{|.|({......)}.,|||{,...,,,,.,,.}}}}},|||,{{{(((...(((((...(((((((...,....,....)))))))....)))))..,,..))))))..,))}}....))))))))....))))))))).}}}}.|))})),..,......{{{((({,..({{{.........)))).})))))},,,)))}}})},,..{{{{{{{.,,...{{{{{..{{|||,,...,))))))}}}..||||,||||{.{{||((..,,,,||}}}|}}|}}.}}))),))))))),,,,,}))(((((..((.(((,...}))).))....)))))
Back