Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr5_0159800
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.3960
CGAUUCUCCUUCCUCAGCCUCACAAGUAGCUGGGACUACAGGCGCGUGCCACCAUGCCCCGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGGCGGGGUUUCACCAUNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCAUGGUGGUGUGAGCUUGUAGUUCUAGCUAGUCAGGAAGCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAACUCAGGAGGCGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-107.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -109.28
Frequency: 0.0404
Diversity: 7.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.(((((((.((...(.(((((((((((((((((.((((((((((((((..(((((((((((((((((((((....)).((......)).....................................................)))))))))))))))))))..)))))))))))))).))))))))))))))))).)...)).))))))).))))))))))(((...((....))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((.(((((((.((...{.(((((((((((((((((.(({(((((((((((..(((((((((((((((((((({....}).{{......))....................................................,)))))))))))))))))))..)))))))))))})).))))))))))))))))).}...)).))))))).))))))))))(((...((....))...)))
Back