Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr5_0318100
Sequence Length
364 nt
GC Content
0.3516
AAGUUAAGCAUUGACGUAUUUUUAACUCAAAAUAAAAUGAAAGAGGUAUUACAGCCUUCUUAAAGUUAAUUCAGAGAAAAAUGUGCAGUAAGUCAACAUUCUUUCAACUAAGAAUAAAUCAUUGUAAUUUCUAAUGUAGUUUUGUCAUGCUGCUUCUUUUCCCCGCAAGGUUCAAACUUAAAAUAUUUAUAGGCACUGAAAAGAGUAUUUCAUAAUAUGCAGACACAAACCAGGAAAAAAACUGUCAACAACUGUAUUUCUACUCUGGUGUGACGGUUCAUGCAUGUAAUCCCAACACUUUGGGAGGCUGAGGUGAGACAAUGCUUGAGGCCAGGAGUUCAAGAUAAGACUAGGCAACAUAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-65.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -74.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 77.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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