Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr5_0545500

Sequence Length

889 nt

GC Content

0.3150

GUGAUAUUAUUAUGUACUGUUUUCUAAGGUCAGUUAAUUUCAAUGAAUAUACUUUUCACCCAUUUACAAUUUGAAAAACUGAUAAUGAAAAUUCAUUUACAACCUUUCUGAACUCAACUGGGCAAGAAAUUAUUUCAUACAUAUAUGGAAUUUUUUCCCAUCUACUCUAAUAAAAAUAAGCAAUUCAAUCCACAAACAUAUAAUCACCAAACAAAUCAAGGAAUUUUCAAAGGUCAGCUCUUUCUUAAUGUUUUUAAAACAUUUCAUAAACUUGUUUAUGAAUGGUAAACUCUCAGUAUGUAAGGUGGUUGUGUGUGUAGCAAUUACAUGAACAGAAACAGACAAGUGUUCAUAUUCUAUAAUAGGUAGUAUAACAAGUAGUAUUUUUUUAAAGUAGUGCUACAAAUUUUUUUUUAACUAACUGAAUUCUAGCCAAAUCACAGAAAUAGUGUAUAUAGACAUAUCCAUAGAUGAUUAUAUGAAUUAAGGAUAUCUUUGAUGUUCUGAGAUCUUAGGAGCACAGCUCAAGUAGUCCGGAUUGUAUUUACAGUUAACAGUAGCAAAUGGACUCUAACUUUGAUCUCAGUGUAUUUAGGUUUUGAGCUCUUAACUUAACCAUUAAAAUAGAUGGUUGUUAAGUUCUUUCUUAGAUACACUCCACUUCCACCUCAUCAUGGGGGUUAUUGUGACAAUUAGAUAAUAACACGUAAAAUAUUUAGUAUAGUACCUAAGCAAUUAGUGCUCAACAAAUUCUAGGUAUCACUACUACAAAAUGAACCCAAGCUAUCCAAGGGCCACCUUGAUAAUAAGUAUCAUUGAUGCCAUAAAGACAAACGGCUAAACAUUUGAGGAAGAUGAUGUAAAGAUACUCAGGUGCUAGAGGGGAGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-186.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -204.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 187.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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