Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr6_0469900

Sequence Length

2505 nt

GC Content

0.4275

AGAGACGUUAAUGCAUCUCUGCAUGAGGACCAAUAGACUCGUUCUUCAUUGAGAUCAAUCUCUGUUUCCAUCCUCAAGGGCCUGGCAGAUUUUACAUUGGAAUCUUUGUCAGCGGUGAAACAAAUGCAUCCAUCACUAAGCUCCUGCCUUAGAAAUGGGCAGUUCUUGAGUUGUUGCCCAAGAUGAAAGAAGGCCAAAAUCUAAUUGAACCUUCAGGAAGAAUUUAGUACAGAGAAACAGCGUUAUCUGAACUGGAGCAUGGCCAGACCCCUAGGUUAAUACCCCAACAGGAGAGACUCAUCAAAGACCUUAUUUGGGGAUCAGCAGUAAUAUUUUUGAUUCUUAAAAAAUGGGCCUUGGAAAAAUUUUUCUUUAACCAAAUGAAUUCCACCAGCAUCAUACAUGUCUGAGAUGUGAACUCUCUGCUCUAUUAAGUGCCUGUAAAGCCCGUAAUGGCUGUAAGCACAUGAACCCAGCUGAGGAUUUGCUUAGUUCUGCUUUGCUCUGCUGCAGCAAGUCCUUCUGGAGACCUGUGGGAACAUAUGGAGCUACCUGAGCAGGAGCUGAUAUUUUAACAGAAAUAUACCAUAUCUGGUUUGGUUCUUUUCUUCUUUCAAUCUAAUUUGGAAUAAUAGGGGCCAAGAACUGUCCAAACUAUUUCUGUUCUUGACUUACGUAUAUGAUACUUAGAAGCAGAAAGACUGUUAACACCAAUGUGACAUUAUCAAGGGGGAUUCUAUUUGCAUUCUUUAUAAAUGUUAACUAUAUAUGGAGGCAGGAACGGGCAGUGAAUGAAGUUAGCUUAAAACAUAUUUGACAUUUAAAUGCCAAAUUCAUCUCCCCCUUUCCGAACCAGCUUGUUUUAGUGAAAUAUUUUUACCUUUAAAAAAUGGGUGAGGGAGGAUUAAUUUAUUAAGUGAGAAAGUCAUAAGACAUUCAGUAUACAUCUCCCAAAAUCUGUAAAUUUCUGUGCUCACAUCUAUGAAGCAAAUUAUUCUGAAUAUGCUUUAGAAUCUCUCAGUUGUGGCAUAAAAAAGGGCUCUACCUUAUUAUUAGAGAAAGAAAAAGAAAAGAAAAUUCCAAAUUUAAGGGUGAGGUGAAGGAGAAGGGCUUAAUUAUUAUAUCUCCCUCAAGAAGAAGAAAAACAGAUACCUAUCUAUGCCCAAGCGCAGCAAGUCUUUAGCAAUCCACACCUUGAGUUCUUUGGGGGAAAACAUGACAUUUUAAGGACUCAGGACAUCCCACAUCUUUCUGAGGCCCUUAAUCAAGGACUUGCAUUUUUUCUAUGCACCCGUUUGGGGCUGGGGAGCCGCAGGGCUUGUAAAAAUGAACUGUGAUUACUACUCUGGAAAGGUCUCUCAUCUGACUGGGGAGAAGGGCCACACACACAAACAAGAGCAGCAAAGCAUGUAGUGCCUGCGGAAAGAGCUGCUGAUGGAAAGACCUGUCAAGCUCAAAGUGCAAGGGGGCAGGUUUUAUGGCAGACAGAGACUUGACCUCAUCCUCUCCUGAGCCCCAACACUGUUUACUGGGCUACUGAGCUCCUUCAGCCUCCCUAAGCCUGACUGCAGAGAGGCCUCAUGGCCAGUCCAUCUAAUGGGGCCUCACCUCACCUCCCACACCUUGCCCAGCACUCUGCUCCUUUUCUUCAAGAGCACUUAUUUUCAUUUGUGGUAAUAUUUUUAUUUGUACUUGCUUAAUAUCUAUCUCUCCCUUUAGGGUCUAAGUCCCUCAAAAGCUGCAUGUUUGUUUACAAUUUCAUUUCUGUAUGCCCAGCCUAAGCACACAGUAGGCUCUCCAUCAGUGUGGUGAAUGAGUGACUAAGCCUCUAAUGAACAGUGGAAUUUCAACAAAAAGAAAUGGAGAAAGCCACCCAAGUAGGGAGAAUAGUAUAAACCAACGUGUAGGGGAAAACAGUGAGUAUAGGAAUUAACUGAGCUGGAAAAAUAGGGUAUGAGAUGAAAGAGAAGGCCAGUUAUAGAGGCUGGGCCAUGGGCUCAUUCUCUGGUGAAUCAUGCACUCCAGGCUAAGGAGUCUGGACUCUGAACCAUAGCAAUAGGGAAGCAAGGAUGUUUUUAGUCAAGGGAGGAUAACACAAAAUAUUUGAGGAACAUGGUAAGGCAGCCACAAGUAAGAUGAGCUAGAGAAGCCCAAAGGCAAGCAGGGAGAUACUGAGGUGGUGGCCGCUGAGGAUCCCAGAUACGUGAGUCUGAAUGGAGGAGAGAGAUUUUGGAAGGAAACCCUGGCGACUGGCACAAAAUGGGGAGGAGGAGGAAGGGUUCUGGUCAAGAGCACAAGGGGACUUGAGUGACCCUUUACAAGGCCUGGCUCAGGGUCAUUUAGACAACAUAGGCUUUCUCAGGCCUUAUCUGUCCUAUUGAUUUCAAAUGAAAAAUUGGUACAAAAGCAUCUUUACCUGCAAAUUAAGGUCAUAGUGAGUCAUGUAGCUGCUAAAAAAUGCUUGAGCAAGUCUCAUGGGCCCAGAGCAGGCGAUUACGCUGUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-700.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -751.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 788.72

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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