Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr6_0470300
Sequence Length
276 nt
GC Content
0.5181
CAGCCACCUUCUCUUCUUCCCCUCCUCCUCCUUUUUGGGUUGCAGUGAUAAUGAGCUCAUUCACUGCUCUUUUUCCAAAGGAAUGAAAAGAGGACCUUUUGUACCAGGGCUUGGAUGCUUUUUCCUCUAAGUGCAAGUAAGGAGCCUGGGUCAGACAAUUGGAAAAACAAUUCUCCAGCCAGCCUUCAGCUGGCAGACAAAGCCGUGCAUCUGACACCCAGCAGAAGAGCACAGAGCAAGCGCCAUCUCUCCUUGGGCAGCUGGGGGCUCGGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-80.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -86.86
Frequency: 0.0001
Diversity: 78.78
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((....)).((((((.((((((((((.((.((((((((..(((((((..(((....))))))))))......))))))))...))...)))))...((((..(((((.((((..(((.(((......))).)))..))))...)))))..))))....((((..........))))((((((.....))))))..........((((.((((........))))...))))..(((..((.(((........))))).))))))))...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((....}}.{{{{{(.((((((((((.(((({,{((((..(((((((..(((....))))))))))......))))))))}..},...))))}...{(((..((((({((({..(((,{,,......}}).))),,)},,},,)))))..)))}.,,{(({,....,,,}}.})},((((((.....)))))).......{{|((((.((((.,.....,))))...)))).,.||.,((,(((........))))).))))))))...))))))
Back