Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr6_0470700

Sequence Length

465 nt

GC Content

0.5978

GAAGGGUAACCUGCCGAAAGUCACACAGGGCGGGGACCUGGAGGGGAACCCAGCUCUCCUGACUCCUGGUCCAGUUCCCUUUGCCACUAAGUAGACUCUUGAGUUCUCCUGAGCUUCCCCCAUCCAGUUUACUUAACUAACCCGGAGCUUCAUAGAGAGCAGGGUGGGGAGGAGGCGGGUAGAAGCAACGGGCCAGGCAGUGGUGGUGGCUGCACAGGCCCAGAAGAACCUGGGGGGCCUGAGCCAGUGCACAGAGCCGAACUGCAUCUCAUUCCUUGCCAGCUCCUUUCUCAGCCUAUGGUUGAAUGGCUCCCAACAUGCAGUGGGUGGACGUCUGACCUGGACCAGCCCAGGGGUGAUGCACUCACCCAGCCUGAUGGGCCCCAGUGCCAGGCUCCAACCUUGUGAGGGCACAUGAGCAUGAGCCCCAGGGGCUGCAUCUUCCUGGGAAGGGAAGAUUGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-183.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -191.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 123.58

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(........)((.((((..(((.(((((((..(((.(((((.((((.((((.((((((.(((((((.(((..(((............((((((((((...((((((....)))))).........))))))))))))).))).))))..)))..)))))).))))((((((..((((((.(((.(((...((((.((((.((((...((((.(.((((..(....)..)))).).))))...)))).))).).).)))....))).))).....))))))..))))))..((((((...))))))......((((.((.((..(((((((.((((...(((((......)))))...))))...))))))))).)).))))))))....))))).)))..)))))))..)))......(((...((((...))))))).(((((((.....))))))))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(........)((.(((,..(((.(((((((.{(((.(((((.{(((.((((.((((((.{({((((.(((..{({,..,........{(((((((((..,((((((....)))))}....,,...))))))))))}}}.}}}.))))..})}..)))))).)))){(((((..((((((.{({.({,.,{(..{.(((..(((((.(((((...(((((((...{{...))...)))))))))))).))).))..))),..)))}.}))....})}})))..)))))}..((((((...))))))..,,..((((.((.((..(((((((.((((...(((((......)))))...))))...))))))))).)).))))})))..,.)))))})))..)))))))..))).,....{,{,,(((((...))))),)|(((((((.....))))))))))).))