Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr6_0470900
Sequence Length
453 nt
GC Content
0.5960
GUGGGCCUUUCAGGGCCCUGCACCAAAUUCUCCUUCACUGCAGGCACCAAGAGGGCAUGGGGACAAGUCUGCCCAGACUGCCCACGUCCAUCCGGGCGGCUCCCAGGGGAGCUAGGCAGAGCUGGGGCUCCAGAAUAUGCACAGGGUGCUGAGGCCGGCCAGGGCACACAAGGGUGGGGGUGCCGCCUGCCCAGGCCCAGCCACAAGUCCCGGCCCCCUGAGUGUGUGUGCAUUUUUCUGGGGAGCAGGUUCCAUGCAUCCAAGAUAAAGAACUAGUGGACUCAUCCUAAGGUUCCUCUUAGACAGGAUUUUAUAAUUCUAAGGUUGUAACAACCACCUCAGGCGGGUGGCUGGUGACAGACUUGGGUACCCGAGGACCCAGCCUCACCCCAAGGAGAGAAGCCUCCAAGGGGGAGACUGUCAGAAAAGGGCGUCCUUGUCCCAGGGAGAAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-187.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -193.32
Frequency: 0.0001
Diversity: 104.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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