Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr7_0009900
Sequence Length
816 nt
GC Content
0.6017
GGUCUUGAUUGCCACACAGCUCUCCUUCUUCCCUGGGGCCUUGAGCCGCCCCCGGCACACCUCGCCAAACUCACCUGCACCAAUCACCUCUUCAAUCUUGACGUAGGAGACAUCGAUCUCUUUUGCAAAUUCCCUCACAGCCUCAUUAGGGUCUUCAUAAGUGAAGGGGUCGAUGUAGACCUUAGUACCAUGUCCGAUGAGAUACUGUCCGUGUUUGUCCGAAUAUUCUGCUUCUCUCCCAUUGCUCUGCUUCCUGAGGCAGAGAACUGCGACCACAAUGACCACCAGGACCAGGACCACACCCACGACUGCCGUGCCCGCAAUCAGGGCCAGCUGCUCCCGCCAGCCCUCGCUCUCAUCCAGUUGGGUCUGGCUGUGAUGUUCCUGGCCGAAGGGCCCGUAGCCGGCCUCAGAGCGCGCCCGUACCUGCACCAGGUAGCUGGCUCCCCGCUUCAGCCCCCGCAGCUCUGCCCGGUUUUCUGACGUCUUCAGGAACCGCACGCUGCUGGGACCCUCGGCGCCCUUCUCAUGGUAUUUGACCUCGUAGUCCAGCACAGCCCCACUGGGUGCCCGGGGAACAGCCCAGGCCAGGCUCAAGCUGCUGGGUGAGGACCGCGUCACCCGGAUGUCAGACACUGCAGGAGGUACCUCUCGGUCAGUGGUGACAUUGACAGGCUCAAAUGGGACGGGCCCCGUGGCUAAGGAGGAUACCCCGUUCAAUGCAGUGACCUCAAAGGUAUAGGUGAAGUCAGGACGUAGCCCUCGAACCACCACCCAGGGCUCCACCAGGUCCCGGGGGCCGGGGUCAAAAGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-299.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -311.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 114.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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