Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr7_0010100

Sequence Length

292 nt

GC Content

0.6233

GUACUGUGAGAGGCAGAGACACAGGGAACCCUUGUGCAUGGUAGCUCUGUCCCUUAACCUCUCGGUCAGUGGUGACAUUGACAGGCUCAAAUGGGACGGGCCCCGUGGCUAAGGAGGAUACCCCGUUCAAUGCAGUGACCUCAAAGGUAUAGGUGAAGUCAGGACGUAGCCCUCGAACCACCACCCAGGGCUCCACCAGGUCCCGGGGGCCGGGGUCAAAAGUCAGGUCUCCCCCGCAGGGCGCACAGGAGCCUCCGGGUCGGCACUCCCGGCAGCGGAGGGCGUAGGUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-108.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -112.71

Frequency: 0.0007

Diversity: 42.21

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((..(((..((((((...((........))...))))))..)))..)))))).(((((((....)))))))...........(((((((((((........)).))....)))))))...))))).))((((........((((...(((((.......))).))..))))((((.(((((((.....((((((((((((.((........)).))...))))))..)))).....)))))))..))))((.(.(((((....).))))).))....))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((((..(((..((((((...((........))...))))))..)))..)))))).(((((((....)))))))...........(((((((((((........)).))....)))))))...))))),})((((........((((...({(((.......))).)}..))))((((.(((((((.....(((((((((({{.((,,,.....}}.)).,.))))))..)))).....))))))},.)))),,{(.((((({...,}))}))})),...))))