Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr7_0189200
Sequence Length
750 nt
GC Content
0.4933
UUGUGUGGCUCUGGGCAGUUUCCUUGGCUGUAGGGGGACUAAUAUUGCCGAUCUCACAGGGCUACGGAGAAGAUGAAACAGGACAACCCAUGAGCAAUUCCCAGCACAGUGUGUGGCAUGCAGGAAGCGGGAGUAUCACUAAAUGGUUCAUAGAAAUAUGAGGCCACGCAUUGCUAUUAAUUAAAAAAAGUUAAAAGAUUAAAAAUCACAUCUCAGGAAGGGCCUGAUGAACAAAAAAGGGAACCUUGGGGAUUCUGGCCCAUCACUGCUUUAUCCUUCCUUCAACACCUGCCACUUCUCAGAGCAUCCGGUCAGCUCCCUUAUCUAUAAAUGGGGGCUGUUAUCCCCCUCCCUGUGGGAUGGCUGUUGGGGCCCCUUGAGACAACGCUCAUAAAGGCCUUAGCCCGGGAGUCAUGAAAGCAUUCAACAAAUGUUGGCUAUUAUUUACUUGAGAGAUAUUGCAAAUUUUAACAAAUAAGGGACAGUCAGUGUCAUGUUCAACACAGGGAUCUGAGAUGAGGGGCUCCCAGAGGCUUGGGCAAGUCCAGCGGGGGGCAUCGGGAAGACCCUCUCUGGUGCUGGUGUUCUGGGACGGGAGCCCUGCAGGGGGCACUUCUCUGCAAACUCUCACUGGGUUUGAGGGAAGAACGGCCUGGAGUUCUUUUUUGAACUUUUCAGAAGCUGCAACAAGAGAAACCUCUACUAUGCUGGGUCCCUCUAGUGAGCCACGGUGCCAAAAGCCUCCAAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-250.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -264.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 154.06
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(.((((...((((....((.(((((.((((((((((.....((((..(((..(((((((..((((..((((((.(((((....(((.((...((((((....(((((((((((....((((.((....)).)).))......((((((....)))))))))))))))))((.((((((......)))))).)).............(((((((.....))))).))......((((...)))))))))))))))....)).))).)))))).)))).......((((.....((((((((((.(((((.(((.(((((((((......(((((.......)))))((((((((..(((((((((((((((...((((......))))....))))))))).....))))))...(((...((((....))))))).........(((((.((((((((...(((((.....)))))....).)))))))...)))))))))))))....))))))))))))(((((....))))).....((((.(((((............))))).)))).)))))))))))))))))))))))))).))).))))(((((((.(((((((.....))))))))))))))..(((((((((((((......))))))..)))..)))).....((((....)))).........))))))))))...))))).))))))...)))).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((.(.((((...((((....((.(((((.((((((((((.....((((..{((..(((((((..((((,,((((({.(((((...,(({.(({..,((((({{,,{{(((((((((..,{..,,.||....}}.}}.}}......{(((((....)))))})))))))))))}|.((((((......))))))..{{{,...,}}}...{{(((((.....))))).)}......,{||,,,})))))))})))))}..,,)).))).)))))||}}|||,,....{(,{{..{.((((((((({,({((,.(((.(((((((((......(((((.......)))))((((((((..(((((({((((((((...((((......))))....))))}}}})}}}}.)))))},,.(((...((((....))))))}.,,,.....{((((.((((((({...(((({.....})))}....}.)))))))...)))},))))))))....)))))))))))){(({|..,,)))))..,,,((((.(((((,,.,,.....}.))))),)))).))})))))))))))),)))))))))).,)),))))(((((((.(((((((.....))))))))))))))..{((((((((((((......))))),.,)))..)))|{{...((((....))))....}},..))))))))))...))))).))))))...)))).)))}...
Back