Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr7_0189400
Sequence Length
382 nt
GC Content
0.5000
AUAUUGCAAAUUUUAACAAAUAAGGGACAGUCAGUGUCAUGUUCAACACAGGGAUCUGAGAUGAGGGGCUCCCAGAGGCUUGGGCAAGUCCAGCGGGGGGCAUCGGGAAGACCCUCUCUGGUGCUGGUGUUCUGGGACGGGAGCCCUGCAGGGGGCACUUCUCUGCAAACUCUCACUGGGUUUGAGGGAAGAACGGCCUGGAGUUCUUUUUUGAACUUUUCAGAAGCUGCAACAAGAGAAACCUCUACUAUGCUGGGUCCCUCUAGUGAGCCACGGUGCCAAAAGCCUCCAAUAGGUUUUUUUUGCAUUUAAAUCCUGUUUCACCGCCUUCCAUUCUCUAGUGGCCUGAGAUUUUACUGAGUCUGGUCUGUGGAGAUGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-122.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -129.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 104.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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