Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr7_0418400
Sequence Length
496 nt
GC Content
0.4214
AGUCUCUCCAGCUGUACAGACAGCCUCCUUUAUCCUAGGGGACAAUAUUCACUUUUGGAUCCAGAGCCAAAAGUCAUAGCAAAAUCACAAGUUUACUUCUUUUCAAUAAAAUUAGCUUUGAAUAACAAUUAAAAUAGUAAAACAAAACAAAACAAAAAAAACCCACCAAUAGCAGCAGGGAUAGGUAUAGCUAACUUUUACUGAGGCUCUCUGUGGGCUUUUCCAACUUACUUAGAGCACCUGGAAUGUCAAUCAUAUUCCCACUGGAGAGAUGUGGGCUCAGGCAGAAUUUACACACAGCAGUCACCAGGCAGGGUAUUAAUAAGGUUAACUGAGUAAUAGCAGAGCGACGCUUAAAGAACUCUGGUCACUCUAGUAACAGUGCCUCUUACCCUAGCUUAACCUUGCCAAAGAGAGCUGGGCGCUUCUGGGCUCAACAAUAAAAUGAAAGGAAUUUCCAGCCACUGAUGCCUGGGAUCACAAGGUCAGGGUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-112.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -123.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.96
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((((....)))))(((((.......))))).........((((((((........))))))))........................................(((((((.(((...........((........))........((((.(((((....(((..(((....((((.......))))...)))..)))....))))).)))).....))).)))))))....(((((((.....)))))))...))))))))).((((((((((.((..........((((..((....((((((((.......(((.(((..(.(((...((((((.(((...............))).)))).)).....))))..))).)))......))))))))...))..))))....))))))))))))..............(((...))).(((.(((..((((.(.....).))))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((((((((....))))}(((((.......))))).........((((((((........))))))))................{,{,.,,..,,{{{{.........{{{||||..............,||...................,,,.(((((....{{(..{((,,..{(,{....,,,}})}},.)))..))).|..)))}|.|}},....,,},...)))))....(((((((.....)))))))..,))))))))),((((((((((.{(........,.((((..((....((((((((.....{,,(({{{{..({(({...{(((((.(((..............,))).)))).)).....))}},,,})}),)}.....))))))))...))..)))),,..)))))))))))}.}............(({...))).(((.(((,.{((({,.....).})))))))))....
Back