Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr7_0420000
Sequence Length
356 nt
GC Content
0.6096
GGCGGUGGUGUGGGCAGCGCUGAGGCACUAUUCUUUAGUUGAGAAGCAAGGGGCAGUCAUGGGUGUGGAGAGGGCAGUGGCCCAAGCAACCCUAGGCAGCAUCUACGAGAAGUUCUUGAAGACGUCCAGGUCGAAGGCCGUGUCCAGGAGGCGCUGCAGCUCCGUCAGUGGGUCUUCUUGUUGCCGGUGGCUGGAGCAGCCGCUGGGUCCCGGCCGGCAUACCAGACGGGCUUGGCGCGGCUGAUGGUGGUCCGAAGUCUUGGCUUCACGUAGUCAUAGUAGCCUUGGUUCUUGUGCUCCUCCUGGCACCAGGCCAGCUCAGCAUUGGGGUACUUCUGCACCUCCUUCAGCAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-140.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -144.88
Frequency: 0.0006
Diversity: 109.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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