Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_chr7_0420400

Sequence Length

677 nt

GC Content

0.6219

GUGGAGGGUUAACAGGACCAAGACAGAGCAGCCAGUGCCCCGGUGGUGGCUACCUGAGCGGGGCUUCCUGGCUACACACAGACUCUGUGGGCUCCAGGUGCUGCCUGGGCCCAGGAGGGGUGGGUGGGGCAUGCUUGGGCCCCACACACAGCCUGGAACCCUCGAAGGAACAGCAGAUAAUGGACACUGCAGAGACUGAAGCUGCCCUUUCUGUGCCAGGUCAGGCCAAGGCUCUCUCCUGCCAGCUGCCCCGGGUCAUCCUCAGUUCACGCCACGGCUGGGGCCCACCCUAGAAACCUCUGCCAGCCAUGGCUAGAUCCGACUCCAGGCUCCUCUACAGAUUCUAAGGCUCAGGCUCAAGAUGAAGCUAUCCUAGUCUCAAAUACAGGAGCCUGUGCCUUGCUGGGUGACAGCGGAAGCCAGCACACAAGGCCCAGUUCCUAUCCUAGUGGGUGAGACUGGUGGGGAGGAUUGUGGCCAGAGCUGACCCCUCCCCAAGGACAUCCCUCGGGGGCUACCUUUCCUCCUCCUGCUCCCCCCGGCCUCCUGGAAAACUGCUCAGAAGUCAGCAGAGCCUGGGCAGCGUGUGGCCUGUGGGGCAGCCAAGCACUGGAGGGGGACGACAGCCUAACUCCUAUGAGAGCAGAGGGAGGGGUGGUGGCACAGCGAGGAGGGCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-294.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -304.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 140.01

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((....((((.....))))..........((((((.((((((..(((....)))....))))))...)))))).....(((.((((((((..((((..(((((((((((.(((((....(((.(((((((........))))))).)))..)))))..)))....)))..))))).....))))..)))))))).)))..))(((((((((((((((.(((...)))..(((........))).((((((((((((...((((((((........))))))))...))))......(((((((((((..(((((((((((..(((((((((((............(((((.(((((((....(((.((((...)))).))).......))))))).)))))((((.....)))))).)))).((.......))((((((..(((((....))))).))))))))))).))))).))))))..)))).......(((.(((.....))).)))((((.....((((((((((((((((((.((((.(.((.....((((((((...((....))..)))))))))).).)))).).))))......))))..)))))))))....))))...(((....))).)))))))..)))))))))))))))...))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.{{{((((..{{{|,},........{.((((((.((((((.{{({,...})),.}.))))))...)))))).,...{,,.(((({((({{,((({{(.,,||||||}}|||||}}..(((.(((((((........))))))).)))..)))).,})))))..||,..},|||{....,,,,..)))),},,.)),..))((((((((((((((({((,.,{||,..(({.....,,,))).{{{(((((((((...((((((({........)))))))).,,||||,.....(((((((((((..(((((((((((..(((((((((((,.,...,{..,,{((({.{{(((((....{|{.|||{.,,)))}.)),..,..,,))))))).|||||(((({.{..|}},)}.}})),||.....,)))((((((,.(((((....))))).)))))),)))}.))))).))))))..))))......{(((.(((.....))).)))|(((.....((((((((((((((((((.((((.{.{(.....((((((((...((....))..)))))))))}.).)))).).))))..,...}))}..))))))))).,..)))}...(((....))).)))))))..)))))))))))))))...))))))))