Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr7_0665500
Sequence Length
1646 nt
GC Content
0.4465
GUGUCACUUCUUAACAACAGAGGGAACUCUUGACGUCAAUGGCUGCUUUUGUCAGGAAAUGCAAACACACAGCCAGUCUGCUCUCCCUUCAAGUUGAAAAACAGGUCCAGGGAUGAGGCUACCAGUGGCACCAGCCCCGCCCGGCUCUCAGAAGGCUCUGGCAGCGUCGCCUGAGCUUGGCAGCACUUGCUGUGACUGAGACCACAGUAACCAUGAGACUCAGGGCCGCAUGAGCAGAGCGAUCGACAGAAAGUGGGAGCUCGCGGUUCUGAAGGGUUCCCACCCCGAUUCACAAGGAAGUACCACUGCUUGCUGCUCACUCACGCUAGGACUAGUUUGCGCGUCUUCGGGGUUCUCCAAUGCAAACUCAACACGCAGGAGGCAUUUUCAAAAUAAUCCACACCUCUAUUAUGUGAACUACUUAUGCUUUCCCGAGUAAUCUGGAUUCCUGAUAAGAAGAGUUCACAGACAGGAAGCAAAAUACCGGAAAGUUACUGAAUAUUCUUCUAGCAGCUUGGCAUACUUUAUCUCCAUCUUGACAACAGCACUCCAGGGCUUUAAAGACGAUCCCCAUUUUAUAGAAGAGAUAGAGCUCCGAAGGAUGAAAUAACCAGGCUUAUACUGGUAAAGCUGAUGAGAGGUGAAUGAAAACUUCAAUUCCAAAGCCUCCCUCUGCUCGUCACGUCAUUCUGACUCUGGCAGCCACAAAGACUUAAGCUUCCGAAGGGACUCUGCACUUAACACUCUAAGAUGGGAUGGAGACGUACCAGGAGAGGAUUAAAACAAGAGGAUUCCGAUAAAGCACACAGAGGCAACUUUAUACUAGAGUUUUGACAGUGUUUGCCCUGCUUAUUAGGUCAGUCUUUGCUAGCUGGGCAAUGGUACAUUUACUGAGUGCCUGCUGUGUGUAUCUCAGGCACCUGCUAGGAUUUGGGUACACAGAGUUCUUCCACAGGGUGUGAAAUUCUUAUUACACCCUAGGGAAAACGCCUCUGGCUGGAAUAGGGUCCACCACUGAUGGUGCAUAUGUAUAGUCCCAGCUACCUGCGAGGCUGAGACAAGAGGAUUGCUUGAGCCUGGGAAGUCAAGGCCAAGCAAGUGAGCCAUGAUCGUGCCACUGCACUCACUCAAGCCUGGGUGACAGAGCGAGACCCUGUCUCAAAAAAAUAAAAAAUAAAUAAAAACCCUGUUCAGAUUCGAAUGGGAAUUCUUUGAGUGAACUGGCAUUUUUGUGUGGCCUCCCCACCAUAAAUCAUGGUGCAUCUUUCCAUGUGUCCACAUGUUAUUUUACAUUCUUCAAUAAGAUUUCAUAGUUUUCUUCAUACAGUCCUGUGUCUUUCUCACAUAAUAUAUACCCAGAUAAUUUAUAAUUUUGGCAUUAUUCAGAAUAAAAUGGUUUUUAUCCACCUUCACUACUGGGUACAUAAUUACACCUGUACAGAGAAAAACUACUGACUUAUGUAUACUGUCUUAUAAAAAGCCACAACAAAUUCUUUUAUGAAUUCUAAUUUUUUAAAAGCACAGUUUCUUGGUUUUUCUAAACAUCCAACACCAUGGCACCAGUAAAGAAGGGCAAUGUUCUCUUCUUUUCCAAUGAUUGUGUGGUGUAGCUCGGUGGUUAACAGUGUGAAAUCUGGAGGCAGACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-470.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -500.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 433.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((..(((((.......)))))..))((((((((..............))))))))........((((((((((((.((((((((((((.((((....((((((.(((((..((((.....((((((((((((..((((..((((((((((..((((((.(((((.(.(((((((((((......((((((((........)))))))))))..)).))))))).))).))..))))))..)).........)))))))).))))..)))..((((....)))).........((.(((((....))))).))(((((((...(((((((.(((((..(((((..(.((((((((((..(((...........))))))))...................))))).)..)))))))))).....(((((((.(.(((...((..((((((....(((...))).....)))))).))...)))))))))))............))))))).(((((((...............((((((........(((.((((((..(((.((((((.(...........(((......)))...(((((((....(((((.......)))))..(((.((.(.(((((....(((........)))....)))))).)).))).......)))))))(((((((.(((((............((((.....((((((((....((((..((((....(((.(((....))).)))..))))..))))....))))..))))....))))....(((((((((((((...)))))))..........((((((.(((....(((.....)))....))).)))))).(((((.........))))).(((.((((((((.((((..(((...))).)))))))))))).)))..((((..(((((((((........)))))))))..))))...)))))))))))...)))))))(((((....)))))..........(((.(((((........))))).)))..).))))))))))))))).))).))))))))))))).))))))).......)))))))))......))))..)))))((......))(((((...))))).........................))))))..)))).))).)))).......))))).)))))).....))))))((((((.((((((.....))))))........(((((....)))))....................((((((((((.(((((((..(((((...((((.......))))...(((.(((((((..........(((((((......))))))).....(((........))).......))))))).))).......)))))..))))))(((((((((((.......((((((((.(((((((........(((((......)))))....))))))).))).)))))......((((....)))).....((((((((....((..(((((((((.......))))))))).....))....)))))))))).)))))))))...).)))))))))))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((,.(((((.......)))))..}){{{{{{((,,...,..,,,.,,|}}}}}})...,,...((((((((((((.{(((((((((((.((((,,..{(((((,(((((..((((,....((((((((({{(,{({{{..((({{{((({.,((((((,((({(.,,(((((((((((,,,...((((((((........))))))))}}.,}}).))))))|,}}}.}}..}}}}|}..||........|)|}}|)))|))))..)))..(((|....))}}.,.......((.(((((....))))).)){{{{{{{...{{{{{{..,{{{{{{{{{||.,|,|{({{,,{||..|||,,,}}....,,||||||||,,{,,..........,,...||||,....{{{{{{{{.{{({{,,,,(((.({,,..}}.}}}.,,,,,}}}}}...}})))}}}..,}))},.,....,,}||}}||||,.,||,,...||||||,}|||||||||,..({{{{{{(((.(((((....,,,(.((((,((({{,{.....{,{({({{((((({.{{,,({(.(((((.(((...(((.,.....(((((.......)))))..(((.((.(.((((((((((({...,)),,)))....)))))},)).))}.((((.((({...))))..})))|||.............})})))...})),))))),.}}|....||,|}}}}|||}||{}...,}}.)),}})),},.,,,...}}}))))),,.,}})))))}...((((((((((((((...)))))))........,.{(((((.(((....(((.....))}....))).)))))}.(((((.{,....},))))).{((.(((((({(|((({..{{{...))).}})))))))))).)))..((((..(((((((((........)))))))))..))))...))))))){|{{{.,{,,|||.(((({....}))))....,.},,.,}|)})))..,,}),,)))))).,.},)))))},((((((.(((({{....}).})))))))))))))})).......)))))))))....,.))))..)))))|.{{{{{.|.,,,,|.}}))),).........................))))))},)})).))).)))).......))))}.)))))).....))))))((((((.((((((.....))))))........(((((....)))))....................((((((((((.(((((((..(((((...((((.......)))),,,(((.(((((((..........(((((({......}))))))....,(({......,,)}}.......))))))).))}.,,,...)))))..))))))((((((((({{...,...{(((({({.{{(((((,,,.....{((((,,,,..}}}}}....})))))),))).)})))....||||||,...,,,,..,,.(((((((,,((.((..(((((((((.......))))))))).....))..}})))))))),}.)))))))))...}.)))))))))))))))).}}},
Back