Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr7_0665700
Sequence Length
600 nt
GC Content
0.4617
GAUGUCAUCAGCAAGAACAGAGUCACUUUCGGUGAGUCGCAGGGUCUCCUCACUCUCGCCAGGAGAGUCCUGGGACCUGUUAUCCAGGCUGUGGGUUCUGGCAUCAGUUGAGAGAAUUUCAACCGGGACAGUCACAGCGUCUGGACUGAUGUCCUGGUGGAGACAGUCCUCCGGGACAAUAACAUCUAAACACGUGGGCUGGGUUUCUCCCUGUGUUGGGAGUGAGUCUGGGGGUACCCGACGGGGCGUUUCUUCUGUUUCGAAGGAGGUAGGAGGUACCUGCACUUCCGGGGAAGACUGCAAUGAGGUGCUCAAAGUGUCACCUGUGAGCAUGACAUCUGUAUCGUCACCCUUUGUGCUUACGUUUUCCUGCAACAAAGACAAGCCUGGCUUAUUUUCAGCAAACUGAAGCUCAGUAUCUAAAGAGUUUCUACAUGACGUUUCUAACAUAGCUUCAGUAAAACCAGCAUUCUUAAGUUCUGUCUGAAGAUCAUUUAUGUGUUCUUUGCUGGACAAUGAGCCUUUUAGUAAGUUUUUCUCUUGAAGAAAUAAAAAGUUUUCUGACAAUUCUUGAACAUUCAAUGGAUCAAAAUUAUCUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-189.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -201.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 164.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((..(((((.((.(((((...))))).))(((((.((((...((((((.....))))))...)))))))))..(((((((((((((((((((......((((((...)))))))))))))..)))))))..)))))....((((((((.(((.....))).))))))))...((.(((.((((((.(((..((....))))))))))).)))))..(((.(((....)))))).((((...((((.((((.....(.(((.((((.(((...((((....(((((.((.(((((((..(((((((.((......)).)))))))..))).)))))).)).)))...)))).))).))))))).)))))))))...))))(((((((((((((((((..(((((((..........)))))))(((((((..((((..(((.(((((.((.............)).))))).)))..)))).....)))))))...))))))))).))))))))..........((((((....)))))).......))))))))).......)).)))))((..((((.......))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({{{({{.,((({(.((.(((((...})))).))((((({((((,,.((((((...,,))))}),,,))))))}}|..(((((((((((((((((((.....,((((({...)))))))))))))..)))))))..))))).,,.((((((((.(((.....))).))))))))...,{.{{{.{{((({.(((..{{....}|)))))})))})))))},{{{.(((....))))}}.{(((.,,(((({{,,,..},}}))}({(((({(.,,..((((....(((({.((.(((((((..(((((((.((......)).)))))))..))).))))}}.)).))),..)))).....,}))))))).,}}}}}}...)))}((((((((((((((({(((((((((,.{{.....,{|,|||,,.....|}}.|||,..||..)))}))))}.....,{{,{,.,..,}}},,}),..}||||.{{{.,,.))).}}))))))))).))))))))..........{(((((....)))))}.......}}})})))}....,,,)),}))))((,.{(((.......))))))
Back