Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr8_0114100
Sequence Length
588 nt
GC Content
0.5068
AUUACAGGCACGAGCCACCGUGCCCAGCCCAUAUCACUAUUUUUAUCCUCAGAACCUGUGUGGUAGGUAGGGUCCCAUCUGUCACUUCUGUAGACCAGGAAACUGGGGCUCUUGCCUAUUGGUCAUACAUUCAGAAGACUCCAGAGAGGGUAUUGUGACCUGGCCUUCUAGCCCUAUGCUACUUGCUCUCUACUAUACGAACUCUAGGAAGUUGGGUACUAGGCAAUCUGUUAAGGCCACCUCAUUCAACCCCCUUUGAGAGCCGGCACAGGAGCUGAGGGCCUCUGUGACUUGGUGACCCAUCUCACUCAGAUGCUAUCUCUUGAAAUUGAUUAAUUGGCUCAGGGAUGAAAAGGUCUCUUCUGAAGCAAGAGGGAGGGUUGGUGCACAGUGAUCACUUCAUUAUUGGCCCUGUCUCACCCUCUUUGGAGGAGUGGACAGAUGACCCUCCAAGACGGCUGGGUCUUGGAGAGACUCGGCCUUUCUGUGGAGUCCAGAGUUGCUACUUGGGAAUGGGGAGACAAAAAAUUCAACACAGGCCAUGCACAGUGGCUCACACCUUUAAUCUCAACUCGCUGGGAGGCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-217.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -226.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 142.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((...(((((((.((((...(((..........(((((.((((((...(((..((((((((((((((((((((((((((....)).)).))))....)))))).)))))))...((((((...((((.....(((((((((((((..........(((((((.((((((.((((....((((((...............(((..(((((((...(((...(((....)))...))).)))))))..)))..)))))).)))).))).))))))))))...((((..(((....)))..))))(((((.((((..((........)).....))))..((((((......))))))))))).....((((.((((((((((....((((.....)))))))))))))).)))))))))))))))))...))))...))))))(((((((((......))))))))).(((((.((......)).))))).......)))))..)))..))))))...)))))..........)))...)))).)))))))...))).))))((((.(((.....)))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((...(((((((.((((...(((.........,((((,.((((((...(((,.(((((((({(((((({((((((((((,,.,||,|||{||}....}}||||.},,)))),,}||||,|,,.,{{{.....(((((((((((((...,.((({((((((((.((((((.((((....((((((...............(((..(((((((...{((,..,((....))),,.}}}.)))))))..)))..)))))).)))).))).)))))))))){{{((((..(((....)))..)))).,}}}...(((({({{({..,,......,}.,.}}))))))}...})))),|..,,},.....((((.((((((((({...,((((.....)))))))))))))).))))))))))))))))),,}))))}}}))))))||||{{({.(((((((((({...)))))))))))..}||,}|}}},}},,}|,}))))).,)))..))))))...,}))),,........)))...)))).)))))))...))).))))((((.(((.....)))..))))
Back