Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr8_0162300
Sequence Length
659 nt
GC Content
0.4355
GUAGAGACAGACUCAUUUUUAAAUAAAGCAAAAUGCAAAGCAUCUGUGACCUAGUCUGGUAUUUUAAUCCAGACUUGAUCAUUAGGGAGAUCUCUGACAAUCAACAAAGGAAAAACCUCCUCCAAGUUAGGGCAGCAUAGGAAAAGCAUUUUAAGAUGACAUCUGUCCAACUGCUCAUGGCUUCAAAGAGCCCCUACUUGAAAUACAAAUGAGGAAAGUGAGUGCACAUGAGGGUAAUACGAGAAGACGAGCAAAAAGGAAACAAUUAGUUGGUGUUAUAACUAUUACUCUUAGAAUAACCUGAUAUUUGACUUUCUCCUCAUAGAAAACAGCUGCCUAACUGUAAAUCUUGAAAGUUAGUAAGAGUAACCCCAAAGUUGGGGUGGGGACUGUAGCUACCUUGGGCGGUGCUUCAUCAGACCCUCCGGAGUCCCAGGACACUGUGGCCUGUCUUCUGGACUCCAUCCUCAUGCGCUCUUCUUGCUGAGCCUUCUCUUCCUCCAGGAUUGUGCUAGAGAGACAACACAUUGUCUUAGGGGAGCUGACAACCCAGAGUUAGCACACACUAGACCCCACCCUGAGUUAUCUAAGGAACACCAGUUGGCUAACAGUAGAUGAUAACAAUAAAGGAUCCUAUACACAGGGGAAAGAAGGAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-179.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -190.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 130.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((.(((((((..........(((((((......((((((.((((((((((.........)))))))((((..((((((....))))))..))))....((((......))))........)))...))))))....))))))))))))))..))))))...))))....(((((....)))))(((..(((.....)))...))).(((.(((((((..(((((((....(.((((((((.((..............((((((......)))))).((((((((..............(((((((((.......(((..((((........))))...))).)))))))))))))))))((((((....))))))((((.(((.(((.(((......))))))....))).)))).(((.(((....))).)))..)).)))))))).).....))))))))))))))..))).((((.((((((.((((.((((((((.(......(((((((....))))))).((((.((((((........))))))..........)))).......((((((((..(....((....))....)..))))))))........).)))))).......)))))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.((((((.(((((((..........(((((((....,.{{((({.((((((((((.........))))))|((((..((((((....))))))..)))),...((((......))))......,,))}..}))}}}}....))))))))))))))..))))))...)))),...(((((....)))))(((..{({.....}}},.,))).{{{.((({((,,{(((((((....{.{{(({({{.((.....{........{(((((......)))))).((((((((..............{((((((((.......{{{..((((........))))...}}}.)))))))))))))))))((((((....))))))((((.(((.(((.(((......))))))....))).)))).,(({((({.{{|||{},,..,,.))))))}}})}}}}})))))))))))))),,))}.((((.((((((.(((({({((((((.(..,...(((((({....})))))).((((.((((((........))))))..........))))...,{,.((((((((..{....((....))....}..))))))))..,.....}.)))))).......)))))))))))).))))
Back