Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr8_0162600
Sequence Length
426 nt
GC Content
0.3803
GCUUGAGCCACUGCGCCCGGCUAAAUGAUUUUUCACUCAAAAAAUAUUUGGUGCGCUCUUAUAACCUGACAGUCAUAAAGCACAAAAAUGCUAGAGUACGCAUUAUAAGAAAAUUUCACUGUUGAUCAAUUGAAAGUAUUCCUAUUGAGGAAUUUUUUAUACUUGAUAAUAGGCCACUGGCAGGUUAAUCUCAUUCUACUUCUCAAUGAAUUCAUACCUAUGAAUAAGUAAACAGGAUGUAGGAAGGACAGGUUCCUUGAGUCACAGACAUCACCUCAUCAAAGUAGGACCAAGGUGAUUUUCCUAUGAGUUUGCCCAACAUGUUCCAUACCAAAAAUCACUUCUCAACUAAUAUAGUCAAAAACAAAUAUACAAGGCUGGGCAUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCUCAGUACUUUGAAAGGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-103.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -110.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 59.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((.((((((((...((((((((.........(((((((((.((((((...(((((((.((((.............(((((........)))))..............((((((.((((.((((((.((((((....))))))))))))...))))))))))...)))).)))))))......((((((((((..((..((((((....))))))..))....)))).))))))((((.((((((((((.(((....((..............))..)))))))).)))))))))..))))..)))))).))))).......)))))))).......((((...)))).................)))))))).)))))))))).))((......((((....)))).......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((((((((.((((((((...((((((((.........(((((((((.((({{(,{,(((((((.((((......,,.....{((((........)))))....{,....,}}.(((((,{((((.((((((.((((((....))))))}))))}...))))))))))...)))).))))))}......(((((({(((..{(..((((((....))))))..))....}))).)))))}((((.{({{{(((((.(((.,..{{..............}}.,)))))))).))))})))),,))),.})))))).))))).......)))))))).......((({...}))).................)))))))).)))))))))).))((,...,.((((....))))...,...))
Back