Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr8_0417000
Sequence Length
348 nt
GC Content
0.3621
GCAUGGUGGUUAAUUUUUAAAUCUCUAAUAUUUUUUUCUUUAUGUCCCAGGGAUGGAUUUUACUCUAAAAGUGAAUACUUAAUGUCAAUACAGAGAGACAUCAGUUCGUGAAGCUGAACUGUCUGAUUGAACUUCUAUCCAUUUCCAGCAUAAAUAUCAAAGUAUAAACUGAUCACUACUUGUUUGCAAUGGGAAGAAAGAUUUACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCAUUGAUGUAUCUUCAGUGGAGAAUGUUUAGCCAGCAUGUAGUUUGUCUAGUCCAGCAUUCAGGAGCUUCUGCCUGCCUGGUUUCUUGGGAGUUCUUUUCAUUCUUCUCCAGCUGGGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-78.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -82.96
Frequency: 0.0007
Diversity: 46.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((........((((.....(((((((((.((.((((((....)))..((((((.....)))))).........(((((.((((.((...((((((.....)))))).)).)))))))))..((((.((((((.(.((((..........(((....)))..........)))).).)))))).)))).))).)).)))))))))............((((((.......))))))))))....))))))).))))).(..(((........)))..)(((((((((((((.....))).....))))))))))......(((((((....)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((((((........((((.....(((((((((.((.((((((....)))..((((((.....))))))........,(((((.((((.((...((((((.....)))))).)).))))))))).,{(((.((((((.(.((((.....,....(((....}))..........)))).).)))))).)))}.))).)).)))))))))............((((((.......))))))))))....))))))).))))).(..(({.......,)))..}(((((((((((((.....))).....)))))))))}......(((((((....)))))))
Back