Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr9_0041200
Sequence Length
348 nt
GC Content
0.3736
AAAUGCAAAUUAAAACCACAAUGAGAUAUCAUUACAUACCCACUAAAUUAAAUAUUAAAAGUGCUAGCAUGUGUAUGGAGACACUGGGACUCAAUACACUGUGGAAUUGUAAAAUGGAAGAGCCACUUUGGAAAAUAGUUUGACAGUUUCUGCUAAGGUUAUACAGUACUAUUAUAUGACCCAGUCAUCCCAUCCUAGGUAUUUGUGAAUAUUUAUAGAAGCCUUAUACAGAAUAGCCAAAAACUGGAAACAAUUAGUUGUCGAAAAGACCAUCAACUGGUGAAUAAAUAAAACUGGGGCUGGGCACAGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCUAGCACUUUGGGAGCCAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-68.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -75.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 111.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...................(((((....))))).....((((..................(.((((...((((((.(((.....(((((........(((((.(((((((....(.((((.....)))).)...))))))).)))))....(((..(((((((.(((...))).))))))).)))..)))))))).((((.(((((((....))))))).))))))))))...)))))...(((((........)))))(((.....)))((((....))))............))))((((((.(((..(((....))))))...)))))).((((((...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,...............(((((....))))).....{{((,,...,......,,...||||{{{,,,{((((({,(((.,,,,{{{.}}}.,}}}||{||,(((((((.,{.(,{,.,..|||,}})},...,}})))).))))),||{{{,..{{{,{{{.,|,..,}},.,,}}}||||||..}||||....((((.(((((((....))))))).)))),,,,}}...},,||,..,,,||}.....,{|||||(((.....)}}{,,|,,,})))}............))))((((((,|,|,.{{{....)))}}}...)))))),((((((...))))))
Back