Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr9_0073900
Sequence Length
669 nt
GC Content
0.4275
GAAGGGAGGGAGGGCAUCAUUUCAGCACUUUAGGGGGCUGAGGCAGGCAAAUUGCUUGAGCUUAGGAGUUCAAGACCAGCCUGGGCAACACGGUGAAACCCCGUCUCUACCAAAAAUAAAAAAAAAUUAGCCAGGCAUGGUGGUACACACCUGUGGUCCUAGCUACUUGGGAGGCUGAGGUGGGAGGAUCACUUGAGCCUGGGUGGUGGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCACAACACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGUGAGAACCUGUCUCAAAAAACAAACAAAAAAAUAAACAAAAAAAAGUAGAAGAGGAAAAAGAUAUCAGUAUAUCAAAAGGAUACCUGCAUUCAUGUGUUACCACAGCACUAUUUAAAAUAGCAGAGACACAGAUUCAACCUAAAUGCCUACCAAUUAAUGAAUGGAUAAAGAAAAUGUGGUAUAUAUACACAAUGGGAUACUAUCUGGUCAUAAAAAAGAAUGAAAUCAUGUCAGUUGCAGCAACACGAAUGGAGUGGGGGGCAGUCCUUAUAUUAAGCGAAAUAAGCCAGACACAGAAUGACAAAUAUCCCAGGCAUGGGAUCUAUGAACAUAGGAUUAAAAAAAAUUGAUCUCAUGUAUAGUGAAUAGAAUGGUGGUUACCAGAGGCUGGGAAGGGUAAUGGGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-169.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -182.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 153.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((.((.((.((((.(((((((.(((...))))))))))(((((......((((((((....))))))))....)))))........))))...)))).))))).)(..............((((.((((((..((((.....)))).((((((((..((((((.((...)).)))))).))))))))....)))))).))))...(((.((((((...((....))...)))))))))(((((((.((((((....(((((.....))))).............................................(((((....)))))..((((((.(((.(((((.((((((.(..((((.(((((...)))))....(((.(((((....((((........(((.........)))..........((((.........)))).)))).....))))))))........(((((....))).)).))))..).))))))....))))).)))...)))))).......((.......))...................((((((....))))))((((..((((.(((((((......))))))).))))))))..............))))))..)))))))...............)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((.((.((.{,((,{((((((.((....}),)))))},(((((......((((((((....))))))))....)))))|.,.....)))),..)))).))))).)(..............{(((.((((((..((((.....)))).((((((((..((((((.((...)).)))))).))))))))....)))))).)))}{,{{,.(((((((...((....}}...)))))))}|||{((((.(({((({{.{(,,,,,}}}}))}},.....................,........,,.............(((((....)))))..{(((((.(((.(((((.((((((.(..((((.(((({...}))))....(((.(((((....((({....,,..(({.,,....,.}))..........((((.........)))).}))).....))))))))........{,{{{....)}}.}}.})))..}.))))),..,,})))).)))...})))))....,..{{.......)),.,.|,,....,,......{(((((....)))))}({{(..((((.(((((((......))))))).)))),}}}.........,,}},)})))),.})))))),..............)
Back