Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr9_0336800
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.4200
GUGAUCAGCCCGCCUUGGCCUCCCAAAGUUCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACUGCACCUAGCCUCUUUUCUUUUAAGAGAUGGGUGUCUUGCUAUGUUGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCCGGGCAUGGUGGCUCACACCUUUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAUAUAGGCAUAUCACUUGAGGCCAGCAAUUUGAAACCAGCCUGGCCAACAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-94.56 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -97.42
Frequency: 0.0096
Diversity: 13.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((....(((((((((((((((.(((((((((.(((.(((((((((((((((((..(((((.......))))).)))))))..((((............................................................)))).)))))))))).))).))))))))).)))))))))))))))....)))..)))))(((.(((((((............).))))))..)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..(((....(((((((((((((((.(((((((((.(((.((((((((({(((((((..(((((.......))))).)))))))..,(((.,,,........................................................)))).)))))))))).))).))))))))).)))))))))))))))....)))..)))))({{.(((((({....,,....,,).})))))..},.)
Back