Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chr9_0606900
Sequence Length
273 nt
GC Content
0.5678
GGGUACAUCAGCCCCUUCUUGUGCCUGUGCUCGGCCACUCUCAGCACCUCAGGUGCGACGGGGGGCAGGGGAGGUGUGGUGAUGUCCAUGUGGUUCCUGGUGGGCAUCGACAGGAGGCACGGGAUUGGCUGGACAGUGCCCAUCUGGCUUCCCUUGCCUUCGGCUAGUUGGCUUCCUGAAGAGGCAGUGGACGAGCCUUCUGCCUACAGUGCAGAGAGCAGAAGGGAGGAAAACGAGUGUAUGUCAUGUUUUCAUUCAUUUAAAGUAUGGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-106.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -112.05
Frequency: 0.0001
Diversity: 67.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......))))((.((((.(((.......)))))(((((.(((((...)))))....(((((((((((((((..((((..((((.((((.((((((..(.....)..)))))).)))))))).(((........)))))))..)))))))))))))))((((.(((.(((.(((....))).))).))).))))((((((((.(......))).)))))))))))(((((((.(.......).)))))))...............)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((......))))((.{{{((((({{{(((,({,,.,,,|,,|||{{..,)))))},..(((((((((((((((..((((..((((,((((.((((((.{{,....)..)))))).)))))))}.({{....,...)))))))..))))))))))))))){{({.(((.(((.(((....))).))).))).)))|((((((((.{......))).)))))))|((,(((((({.(,,.....),))))))).})).......,,,,)).))
Back