Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chrX_0214500
Sequence Length
605 nt
GC Content
0.4496
GUGAUAGCAUAUUCAAGUUGGUGCAAGGAGCAUUUAUUGGGCACCUGCAGGAUCCCAGGCAGAGUAUUUUCUUCCACACCUUUUAACAGAAAUAUACACAGAAUUCCAUACAUGCGUUCCAAGAAGAACAGAUGUUUCAGAGGGACUUGAUGGUUCACCUCCCUAUGUCCGAGGCCUCCUGGUGCCUGUAAAGCUUAAAAGAUAUCAGCCGAGUGCUGUUUCAGAGAUGAGCCAAGUUUCACACGGGCGACUGGAUUAGAGAAGUGUUACCUUCCUGCUUACUCUAAAACUGCAUGCUUUUAGGUUCAACAAUUAAUAUGAAAAAUGGGACAAGGGCAGCAAAGGACUUUAAGAAAGGUCAGUGCUACUCUUAUAUUUUUUAAAAAAAUCACAAAUUACCUGGCUCCUCCAAAAUAUCCAUCCUCUAGUUUUCUAAUUGUGGAGAGCACAGCAGAAUGAAUGUCUGAGCCAUCAUUUGUGAGCAUGGUGCGACUGAUGGGGAAGGUGAGUGUGGGUCUGCCCGUCAUCCUCCAGCAGGUGCACAGGUAGGCCAGCUCGAUCCUUAGCAUCUCCACGAUCAUCUCAUUGUCGAGGGCCAGGUAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-163.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -174.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 127.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((........)))(((((.(((((......(((((((.((((.((...))..)))).(((((((((...............))))).))))............((((..((((......))))..)))).....(((((..(((....)))..))))).)))))))...))))).)))))(((..((((((((((...........((((.((((.((((.(((((...........(((....)))....((.((((......))))))))))))))).)))).)))).))))))))))..))).......(((((((((....(((((.((((...((((((....))))))..)))).))))).))))))))).....)))))...(((((((((.((((................(((....)))((((((((((((....((((.......))))..((((((.(((((.......))))).))))))..(((((((((...((((((((.((((((........)))).)).)))))))).)))))..)))).)).))))))))))............)))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({((,,..,,..|||(((((.,,((({.{{{,{{((((({(,{{{((..,||.{|||}.(((((((((...............))))).))))............((((..((((......))))..)))).....(((((..(((....)))..))))).))))}},}).}))))})))))|||,,|||||{{{{|.|||||||.}}||{{|{{{{.{({(.(((((,.,{{,.,...,,||,,.}}|,.,{(({(((({,....,,,,,,)))),)))),)}}).)}})})))})}))))..}),.......(((((((((....{((((.((((...((((((....))))))..)))).))))}.))))))))).....)))))...(((((((((.((((................(((....)))((((((((((((.,,,(({,.....,}})))..((((((.((((,.......})))).))))))..(((((((((...((((((((.(((({(,,.....,)))).)).)))))))).))))}..)))).)).)))))))))).......,},..)))))))))))))..
Back