Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_chrX_0350400
Sequence Length
793 nt
GC Content
0.4061
GUUUGCUAAGCCUCUGAGCUAUGUGGCUUUUGCAGACCACCUGAAAUGCUUGACAUAUUACUGAAAUAAGGUGAAAAAUGGUUUUCCAAAGUAAAAAGCUCCUGAAGUUGGUAAUGGAAUAUGAGUACUUGUACCAUGUGGGCUCCCAUUCAAAACUGCCAUCUUAUCCCUUCCCUAAAAUAUCUCUGCACAUCAUUCUCUUCUUCUUGCUGAGUCAUGGUUUAUUUAAGAUUUGCCUACAGCAAACACAAGCAGCAUUUCCCUAUGUAGAAACCAGGUUGCAGAAAAUGUAGAGAUACAGGCUAUCGCAGUUUUAAUAUAACCUGGCUGAGUUUCAUUAGGUUCAGCCCGUGGGGCUCCCCUAGGUCAAACUGUAAAGUCAAUGUUGCAAGCUACCUGAGCUAAUUUGUUCAUGCACAAUUUUUAGGUUCAUUUUAGAUUACAGUUACCUACUGUUAGGUAAGGUAACAGUAAUCGCAGAAAAAGAAGGAGACCAGUGAUAGUUUGUAAUUCCUCCCCUCAUCAUGUGUGUCUCAGGCCCAAAUGUGUUACACAUAUAGGCAGUCAUUCAUCUGACUUCCACAGCAGACAGAAAACAGUUCAUAUGUCUCCUUCCAUAAACUUGUGAGAGGUACAACUUCUAUCAUGUAGCUCUUUGCCUCUCAAGUCUUUAAGGACAAAACAAGUGGUGUUCUUUUAUCUUUCUCAGUCAGCAUCAGGUAAUGAGAAAUUUUCCUUAGUCCAUGGCUGAGCGUAGGACUAAAGAGACUUCAAGUUAUGGGCACUGGAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-205.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -219.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 170.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((((.(........).)))))..))))))(((((((..((((.(((...(((((.......)))))....(((....))).(((.....)))..(((....(((((.(((((((...(((((((.....((((....))))......((((..............(((((((((((((((((.....((((.......((((((((.((.(((((.....))))))).)).))))))......(((((.((((........))))....)))))))))..))))))))))..((((...(((((((.......((((((..(((((((((..(((...))).)))))))))..)))))).)))))))..))))..(((.(((.......(((((......)))))))))))..))))))).........((((((.((((((((((....))).))))))).)))))))))).....(((((((((..((((..((((((................((((((((..((.(......).))..)))))))).((.(((((......))))).))...))))))..........))))..)))))))))..........(((((((((......((((...)))).....))))))))).((((....))))...)))))))))))))).)))))....))))))))))))))))...........((((...(((((((((((((.((............))))).))))))))))...))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.(((((.(........).)))))..))))))(((((((..((({,(({...,,{((,,...,{|||||,,..(((....))).,,{.....|},,,{(({{.{(((({.{(((({{,.,({({{{{..,||{{{(|,..,,}},..,,,{{||}|.,,.........((({{{,((((((((((.....,,,,.......((((((((.({.{((({.....})))}}).)).))))))......(((((.,(((........))),....))))),}},..))))))))))..((((.,.(((((({.......((((((..(((((((((..(((...))).)))))))))..)))))).)))))))..))))..{{,{(((.......(((((......))))))))))),.)))))))....,||,.((((((.((((((((((....))),})))))).))))))..,},....(((((((((..((((..((((((................((((((((..((.(......).))..)))))))).((.(((((......))))).))...}}}})}..........))))..))))))))){{{..{{{{{(((((((((......((((...)))).....))))))))}.((((....))))...)))))),)))}},),)))))}}..))))))))))))))))..........,{(({,,,((((((((({{{{,||.},,}},,.,,}}}}}},,)))}}}}))...))))..)
Back