Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_snoU13_0006800
Sequence Length
681 nt
GC Content
0.4200
GUAAUGUUGUAGAGUUGGUGUCCAUUCACCAUUAUCCAGAAUUUUCAGUGCUAAGCAAAAAGCUCCUGCUGCAAUUUGAGAAGGAGGAAAGUGCACCAUGUCAUAGUCCAACAUAGUUAGUUCCAUCAGGUAUUUGGCCAAAGUAUGUUGCUCGACAUCAACCUCUCCAAUCUUAGAUGCUCUCCGAAGGAAGUGCAAAGGUAGAGGCCGACCCAGACCAAAGUUUAAAGCUCUUAGAAUCUUCAUUUCCAUCUGUCUGAUUUGGUGCUUAGUAUAAGUGUUGUCAGUCACAAAAGCAAAGUCACCAAUUUCUGGAGGGUACAUUUCUUCAUAUUUGCUUGCAAUAAACAUGGCAGUGACACCAACCAGCUGCAGCAUCUUCUUGGGCACACAAUUAUUCUGCAUGAACCGAUCAAUAAUGGAGACAGUCAUGUACAUGGUCUCCUGCAACAACCUGAAUUUCAUUUGAACCUGUACUAGCCAGUCAAUUAGGAUGGCUCUCAUGUUUCCAGUGACUUCCCGACCCAGUAGGUAUUUUGGUCUGACUGCUUGCUCUUCCUCAAGUUGUCUCAGAUAAGCAUAAAUAUCUUUCACAUAUUCACUACAAAGGUUUGGAUCAGCUCCAUCUUCUGCAUCCACAUCAUUUACUGCAAGAAUUACAUCAGAGAAAGCCUGACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-147.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -163.07
Frequency: 0.0000
Diversity: 158.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((((((.(((((((((.(((..((((................(((.(((((((.(((....)))...((((((((.(((((...((.....(((((...(..(((((((.((....(((.........)))...)).)))))))..))))))..)).)))))..))))))))(((((((((((((((((..(((((.(((((......((((....))))...)).)))...))))))))))))(((.....)))(((((((((.((....(((........)))....)).))).)))))).))).))))))).............))))))))))......)))).))))))))))))...)))))))))....(((......)))..((((((((((((...........((((((((.....(((((.((((.........................).)))))))).(((((.((......)))))))....))))))))..((((.....(((.....))).....)))).(((.(((((........))))).)))..(((((........)))))...................(((.((((((((.........))).))))).))).)))).))).))))).............))(((...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((((((.(((((((({,(({..((((......,,....,...(((.(((((({.(((....))),,.{(((((((.(((((...{({....(((((..,(..(((((((.((.,..(((.........))).,.)).))))))),,,))))),,,}.)))))..))))))))||(((((((.(((((((..{((((,((({,......,{{{....))),...})})),...)))))))))))),||.....||,(((((((((.((....(((........)))....)).))).)))))).,}},))))))}........,,...})))))))))......}))).))))))))))))...))))))))).,,,((({,,........{{{{{{{{{{{.....,,......((((((,.,,,.,.,,|,||}}}}},,,,....,,,{....{{{{{.|{{|,||,,..(((((.((.....,),)))))..}},)}))},}}}||.,.,..{{{{.,{.{{|{,{{||}|||,(((.(((((........))))).))}.,||||{.....,,,)))))...................||{.((((((((.........))).))))).}))..,,..))),,))},....},}}}}...))|||...)))
Back