Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

HSALNT0249688

Sequence Length

871 nt

GC Content

0.4351

GUUAAACAACUUCUUAUUCCACAACUAUCUAGAAGUAAAAAUUACUAUAAAUUGAAUGAUGAAAACUUCAGGUCAUUCCUUUCAAAGUCCUUUCCAGUGCUGCAUGGAGAAAAAACGCAAUCUACAACCACAACAAUAAAUGAGGUAUGAGAUUUAAUUCUGGAUAUUACAGGGAGGCUUAAUGAAGCAGAGAAGUGGAUUUCCGGAGAAGGAGAGAUUAAAGUCUGGAAAAGAAGUAUACCUGUCUGGGGAUUAAAAAACAAACAACUUUGAACGGUCAAGGAACCUGGAAACCAAGCUCAUAAAAGGUUUAUGCAAACAUCAAAUGUGGCAUCCCACAUGGCAGCAGCAGAAAGGCACUGGGGUAGAAGAUGAGUGAUAAUGAGGUUACCCCGGAAUGCAGUUGGUUGGCUGGCAUGCAAAGGGAUCUUCUCACUUUGUUGGAUAUCUGAAAUGUGUAUAUGUUUUUUUUGGAAGCAGAGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUACAGUAGCACAAUCAUAGCUCACUGCAGCCUUGACCUUCUGGGCUCAAGUGAUCCUCCUGCCUCAGCCUCCUGUGUAGCUGGGACUACAGGCAUGUGCCAUCAUGCCCAGCUAAUUUUUUAAUUUUUGAGGGAGACAGAGUCUCACUAUGUUACUCUGGCUGGUUGCGAACUCCUGGCCUCAAGUGAACUGCCUUGGCCUCUCAAAAUGCUGGGAUUACAGGCAUGAACCACUGGCCCAGCCUGAGGUGUGUAUUGUUAUUGUUUGCUUUGAUGUUGCUCCCUGCAACCCGAAUCAUGCCUUACUGCCAAUUCCUAGAAGCAUUUACUCCAUUGCCAACAGUGAACUUUUAUGGGAAAUUGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-241.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -258.10

Frequency: 0.0000

Diversity: 224.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((((................))))))..............................((((((((...((.((((((((..((((((........)))))).........((((.(((((.((........)).))).))))))((((((((.(.....(((((...((((.......((((........(((((......)))))........))))......))))...))))).).))))))))..........)))))))).)).....).)))))))..((((.((((((((((......((..((((...)))).))(((((.((((.(((((((..((..((((((((((((...((........))....)))))))))..)))..)).))).)))).))))....)))))....(((((..(((((........((((.(((.((((((((...(((((((((((...))))))))((((((((((((((...(((((.......(((((((((..(((((.((...)).)))))..))))).....((.((((((.........((((((((......(((....)))......))))))))............)))))).)).((((((..((...))..)))))))))))))))..))))).((((...((((...(((((.(...(((((......)))))...)))))).....)))))))).)))))).))).............((.((.((((..(((((.....))))).)))).)).))............))).)))))))).)))..)))).)))))))))).))))))))))...)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

........{{((((,.,,,,.....,{,,,||||||{....,}}}}.......|{{|||,|,....{||{{{||,}||{.{{{{{{{{..((((((........))))))........,((((.{{(((.((........)).))).}}))))|{{{{||||||,,..{((((.,.((({....,.,((({,....,,,(((((,,,...}}}}}..,,....))))......))))...}))}}|||}}}}}}},..........}||||||,.,,,,}}}),}}}}}}}..((({.((((((((((,,..,{((..((({...}))).}}|((((.((((.(((((((..{,..((((((((((((...((........))....)))))))))..)))..}}.))),}))).))))....))))}....{(((|.|(((((..,......,{{.(((.{(((((({...(({((((((((...)))))))}{{|(((((((({({.|.(((((.,,......{|(((((,.(((((.({...}).))))),.)))))...,.((.((((({.........((((((((......(((....)))......))))))))............}))))).)).((((((..({...})..))))))||}})))))..})))}.((((...((({...(((({{(...(((({......)))))...}))))).,..,)}})))))})))))).))),.{,,..{,.,..{{.{{.{{((..(((((.....))))).}))),)).))..,},.,||,,|})).}))))))}.))),.}}},.)))))))))).))))))))))...)))).