Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

HSALNT0293682

Sequence Length

777 nt

GC Content

0.4633

ACACGGAGCAAAGCACUCAGGGGUUCAAGCAGCAUCAGACUUCCCCGCGAGGUUCCUCCACUGCCUUUGUCACCCGCCAGUGUGAAGUCUCCAACCCUCCCCGUGUGCAGUCUGCGCUUGGGAAUUUGUUGUUGUUUGUUAUAACCCAAAUAUACUUGAAAGGUAAAGCUUAAGAGCAAACUUACCUGGUGUGGGCACUGCAGCGUGAAGAGUUCUCUCACCCAUUGCUCUGUCCUCCUGCGCCUGGAUCCUCGAGAAACGGACUGUUCUUAGAAGCUGAAAGUCCAGCCGGAUUUACAGACAUCCAAGUUUGUUGGUGGAAGGGACUUACCAUGUCUCAGACGAAACUUUGGACUGUGAACUUUUGAGUUAAUACUGCAAUGAGUUAAGACUGGUGAGUGUUCAAUAGCAAAGACUUGGAACCAACCCAAAUGUCCAACAACGAUAGACUGGAUUAAGAAAAUGUGGCACAUAUACACCAUGGAAUAUUAUGCAGCCAUAAAAAAUGAUGAGUUCAUGUCCUUUGUAGGGACAUGGAUGAAACUGGAAACCAUCAUUCUCAGCAAACUAUCGCAAGGACAAAAAACCAAACACCACAUGUUCUCACUCAUAGGUGGGAAUUGAACAAUGAGAACACAUGGACACAGGAAGGGGAACAUCACUCUCCGGGGACUGUUGUGGGGUCGGGGGAGAGGGGAGGGAUAGCAUUAGGAGAUAUACCUAAUGCUAAAUGACGAGUUAAUGGGUGUAGCACACCAACAUGGCACGUGUAUAUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-231.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -246.23

Frequency: 0.0000

Diversity: 198.54

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((...(((((...((((.(((((((.....((((((.....))))))......))))..)))..))))...)))))...).))))..((((((((..(.((((((((..((((((((((((..(((((.....))))).))))).........((((((.(((....)))....))))))((((((((((..((((.((((.((....))))))...))))..)))))....)))))....))).))))...)))))))).).......(((.((((((....)))))).)))...(((((((((.(((.((...((.((((((((.(((((((.(((....)))..)))..(((((((((((....))).))).))))).)))))))))))).))...)).)))))))))))).((.((((...(((((.....((((((.((((..........((((((.((((...............))))..))))))...(((((((.((((((((((((...))))))))))))............))))))).))))....))))))...)))))............(((..((((((((((((....))))..........))))))))..)))((((((...(((((.......))))).....))).))).)))).))......)))))))).((((((((((.......))))))))))........((((...(((((...)))))....))))..))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((...(((((...((((.(((((((.....((((((.....))))))......))))..)))..))))...)))))...).))))..((((((((,.{(((({{{{||||{,{(|.,{{(((({(((,..{{{|{,|{{{{|....,,|||..,|||||.||,,,,.))),,,.}},)),||||||||,|}}|||{,{{{,,({...,}}))}},{.||}|,,||{{((((.{{.(({{{.((({(({{,..,,||.((((({{....,(((.((((((....)))))).))).,.(((((((((.(((.((...,(.((((((((.(((((((.(,,....}}}..}}}..(((({{(((((....))).))).))))).)))))))))))).)),..)).))}})))))))).....,,,...(((((.....((((((.{((,..........((((((.((((...............))))..))))))...,{(((((.((((((((((({...}))))))))))}......,....,))))))),,)))....))))))...))))).....,,.....{{{..{(((((((((,...|}}))),}},......))))))))..})),..,,))..|}}}}}}}}}..}})}}}}}}}}|,,...))})),)))))),})))))))).((((((((((.......)))))))))).....||.{{{,.||((((|...))))),,},}})).,))))......