Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0310552
Sequence Length
5570 nt
GC Content
0.4546
AGGCAUGAGCCCUUGGGCCCAGCCGGCUGUUUAAUGUUCUUAAAUAGCACAAGGGACUUCUAUGAACUUUCCUAGAUGAAAUAUUUAUUAACUACUAGGUAAAACACUUGUUUGAUACUGCAAAGGGUUAUUUCUGAAACUUAAACCUCAUGAUUGGCCAACCAAGAACUUUUUCUCCACAGCAUGCUUUAAUAAUGAAAUGCGGAUUAAGAGUCCAAUAUUAUAAAACAUUUCCACAAAAGAAAGAAUCCAUCUGAUUCUCAACUCUGAAUGCACAUUUGAAUUCCCUCGGGGAGCUUUUAAAAGUCUAAUGCCCCAGUGUACCCCCCCCAGUUAAUUAAUUAAAUAAUUCUCUGGGGAUGAGAACUGACUGACAGCAACACUUAAGCUUCGAGACUGCAGUGUGCAGCCGAGGCCCACUCCUCCAGCGUCACCACCUCGUCUUUAUCUGCCACUGUGUCUCCUCAUUGCCCACAGCUUUAGCAACAGCAAAAGUAGAAUUCAAACCUUGGUAAACAAGGCUUAAAUUAUUACUGUUCAUGACCUUAAUUAAUUGAAAAUGAUUACUGGUGACCACAGCACUCCAUGCUCUUCCUUAUGGAAAAAGGGUUGCCUAGAAGAUUUAGGCAAUACUGGGAGUUCUUAUUUGAAGUCACAGAAAGGAGAAACUUUUCUCAAGCCGUUUUUAUUACACUUAGUGUAUUAAGACAAGUACAAAAUAACCUUGUAAUUAAGAUACUGUAUCAGUCAAAAAAGAAGUCACUAUUGUAUGAAGAGAUUUACAAAUGACUAAAAUAUACAGGCUGUGACAGAAUUAACAGUUUGAAAGAGGGUUGCUUUUUUCUUUUAGAAAUGCUAAAUUUUCUUAACAAGACAAAAAUACAGUGCUCUAAAUAUGCAUUACCAUGAAAACGUUAAAGAAAAGCAGUCUUAACACUUAACUACUAUUAACAGCCUUUGCCAACACAUGCCUGCCUACUCCCUUUCCUAACUUUAAAGAACUGUUUCCUCUAAGGAAUACUAGUGCAGCAUAACCCUUAAAUAAUUUCAUUUAUUUUUAAAGUUACAACCUACAGAGAAAUUAACAUCUUGUCAAUCUAAUAACAGUGGCAACCAUUCUUCACAUGCACUUCUCUUAGAAUAAAUCCCCUUGGCUGGCAGGAUAAGGCUUAUGCUGUAGAACCUUCUCCCCCACAGCCACAAAUCCCCUUCUAUAAGUCCCUCCUACCCUCAUCCCCCCGCAUCCCCACUGGCAUUCACCUUUCCCACCCCAAAAAGUGCAGCUCAUGGUAGCCUUCUAGAAAAUGGUUUUAAUGGGUAUCCCAGCAUACACGCUUUUUUAAAAGCCCCCUCUGAACACCAGAGGUGGUGAAAAUGAAUUGUGUUCUUGGAUUUUUUUUUUUUUAAGCCUCCACUGGGUCAAAAAUAUGUGCUCUUAAUACUUGAGUUUUUGCUUUGUGUGUGGGUUUUCUUUCUUUUUCAUUUAGAUAUCGUGGGAUAAAGUGGAGAGGACAUCUCCAUUUUCCCAUACAAACUGAGGGUGAGAAGAGAAAGAGAAGCAAGCUGUUGCCCCCACUUUGGCCUGGCUUCCCAGCCAUCUUCCCAGCUCUGGUUCUUUCAUAGGAACUAGUUAUUGCUUCCACAAUGCCGUUAUACGGAAUGUUCCACAAAGGCUGUGAACCUAGUCACAGUCUACCCACAACAAGAACUCUGCUCUGAAAAACCAGCCCAAGAGCUCUUACCCAGAAGAACAAUCUUUAGCCCUCAAGGUCACUGAAACUUCAUUAGAGCAGUUUAGAGUAGACGUGUAAGAUUUGGCAUAUAUUAAAUGAUUAUUGGCACAAUGUUCUCCAGUUCCAUGUAUAAAUGUUGAUAUGCACAUCGGCCAGGGCCCAGGAUGAAUCAGCCAAUCUGCACCAUUUUUAUGUCAGCAAUAAUUCCAUCUCUUCCCUUUGAGCACUGUAGGGAGAGCUGCUUCAUCCGGUUCUCCAAGGCCUGGCCCUCAGGGGAGGUGCUGCUUUGGCUCUUACUGCUGCCACCACUGCCACUGCUACUGCUGAGGCCCCGGUUGUUGUUGGCUUUGUCACUUGUUUUAUUCUCUGCCCCUUCUGCCCUGUCUCCUAUAGAAAUACAAGGAUUAUCAAAAGUGAGUAUUGACAAUUCUGCCCUGUCUCCUAUAGAAAUACAAAGAUUAUCAAAAGUGAGUAUUGACAAUUCUAAGUCACUUGAGCUCAAACCAGUCAGCUAACUCAGCCCUGUAGAAGUCCCACUGUUACCUACCGUGCCUAUCAGAGAGGUUCUCAGUACAUAAUCAUUUACUGCUUUUAUUCCUUGUGAUGUUUUAUAUAUUCCUUAGCUAUAGAGAUGAAAUUUGCCAUAUUCACUUUAUUGCUGAGAAACAAACCUCUCUACUAUGUGCUUGCCAAGGAGACUGUUCUGAUGUGAGACAUAGGACCUAAGCUCUACUUUAUAGAAGCUGAGUGGAGCCAGGAGCCCCCCCAGAACAGCACUUGGAAACAACCUCAGUGAUCAAUACUGACAGCACAACCACAGAGACCUGGUAAUGCAGCAUGGGGGCCCUGAGACCUGGCAGAGGUAUGGAAUGGCACAACAGUCAGGCUACAGAGGCAGUGUGGCAUCUGGGACGGGGUGAGAAGGCUGCUACUCACCUCGUUCUACUUCACAUUCAGGGGAGGAGGCCCCGCUGCAUUCACUUCGAGGGCCCAACACUGGGAACAUCAUCCCAAACUCUGACAGGGACACAGGGCUGGGCAGAUCCAGGCUGCCAGGCCUCACAACCGCAGGGAACUGGUCAGGCAUCUCAGACGGGCUUGUUGGUCCUGAACUAAAGCUGGACACGGACUGGGUUUCCGAGUCAUCUUCAGACACAAAGUUGCUACAGCUGUCAUCUUCAAAGGCCUCCGAGGCCACUAAGUUGAGAGAGAACACCAGUCACAUGGGUUCUGUCACCUCCUCAAACACCACAAGUGCUUGCUGCUGGCAGGCAGCUAGACACAGCAUGGGGGACUAAAGAGUCUCUACCUCUGUGAGUGCCUAAUGAAGGAAUGUGACUUCCCAAGCCUGAAUGACCAGCCUCUAAAGCAGCUGGAAGGGAAGCAGCUGGCAGCAGGAUCCCAUGGAUAUUAAGCGCCCUUCCAAUAACCUUAUAACCCUGCCAAGAAAUCAGUGUCACCAGACACCACCUAAAAAUGGAAGAUUAAUUCAGCCACAAAUUAGGACCUUUACUCCACCUCAGUCCCCCAAAUACAUCCUCAUGUGCACAGGAAGAGGUUCUAGUCCUCUGUAACAUAUCCCAAACAAAGCCAGCUGGACUCAGGCUUCUUUCUUAGGGCAAUAGAAGCAAGAGCUGCUAGAAGAAACAGGCCAGCAUGGAACAUCUGUUGGGACCUUUGUUAUCUCCAGAAUCCUGACUUUGAGGAACACUUAGUACCUUCUUAAUGAACACAGUGUUCCAUAAAACAUGGGAACCCACCAGAAAUAGCCCUCAGGCCUGCCCAACUCUGAGACCUUUCACUGAUGGCCAGAGAAAGUGAGGACCUUGGGAAACAAAUCACACAGUCUGAUAUCUCCCCACAUACCCAGUGGAGCCCCUGACUUACCAGAAAUGGCAUCAGGCUCAGGUUUGCUCCCUGGCAGAUCCUCCACAGAUGUGCUGCUGCCCUCAGCACCAACACCGCAUCCCCGAGGCCCCAUGGCACUGGAGCGCCGCCGCUCGUGGAUCUCAUCUGAGAUCAUCUCCAGGUUCUUCAGGGCCAUCUUGUACUCGCCUUUUGCCAGGGUCAGUUUGGCCUGCAGGUCAUCCACAGUCUUUUUCAGUUGCUGAUCAAGAGAACAGGAGACUAAGUGAAGACUACCCUGCUAGCCUUAAGAUGCUUUCUGAAUGACAGGUUCAAGUACAUUUUCUGCCCAUCAUUCUACUUCAAGGAAUUUUCCAAGACAUGACUGAAGACCUAAUUACCAUUGUAACUGCUAUUCAUUCACCAGACAAAAUCAGCCACCACCAUCCCCAGAUCCCAUCCAGGUGACAACCUCUAAUAUCCAAAAACUCUCACUGGUGGAACAAACCCCAUCAGGGAAGCAAAAAUGGGCAUCAGACACACCAAAGUCCCACAGUCUAGACAUCUGGUUCCCAGUACAGUGGUUCUCAAAGUUGAGCUUGCAUCAAAAUCCCCUUGGGUGUUAAGACUCAGCUCACUAGACUCCAACCUCAGAGUUUCUAAUUCAGUCGGUCUAGAGUGGGACCUGGUCUAUCAGGUCUCCAGGUGAUGCUGAUGCUGCUGGUCCUAAGAGCAUGCUGUGAGAACCACUGGCCUAGUACAACAGAGAAGGUGACUGAAUGGCAGUUACAGAGGUUCAGAGACCACUGAAGACCCAACCGAGACAAUUUUGAGGUCUGAAAACUCAGUAAAGCCUGUCUCUCCACUUUCCCCUUAUAGCAAGUGGCCCAUGUGAUACUCUGCUACCCCAGAAAAGUGAAGCUUUGAGUGCAGAAAAAUCUCAUCAGUGACGAAGCCCAAAGCUACACAUACCUCGAGCUGCACAUAGUACUUUGCCUUGAGUUCAAAAUAAGGCCUGCAGAAGACAGGAAGGAAAGCCAUCAGAGUAAUAUAAUACAGUGACCACAGUCAACUCCACAAGAUGAACAAGAGGCAUCAGCUACCACUGGCCAGGUCGUCCUUCCAAUAUUUAGUAAACUCUUAACAAGGCCGUGACAUGUCAGUGAUGCUCCUAGCUCUGGAGACUGACAGACACCAGAUGGAACGACUGGGCUCACCCAGGGCUAUAUUAACAGGAGGCCCAUCUCAAGACACGGGGAACCCACACACACAUAUCUUGGGGACUCUGCAACUUAGCUCAUGUUCCUCCUCUGUGGGAAGGCUGUUCAGAGCCUCACAGGUUAUACCCAGCAGUAAGGGUGGCCUGGAUCUGCUCUCCUAAUGAAGUUGGCUCCCCAGGGAUGAAGAGCAGCUGAGGCUGGA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1631.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1738.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 1413.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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