Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0310559
Sequence Length
598 nt
GC Content
0.4599
CUAAAGAGUCUCUACCUCUGUGAGUGCCUAAUGAAGGAAUGUGACUUCCCAAGCCUGAAUGACCAGCCUCUAAAGCAGCUGGAAGGGAAGCAGCUGGCAGCAGGAUCCCAUGGAUAUUAAGCGCCCUUCCAAUAACCUUAUAACCCUGCCAAGAAAUCAGUGUCACCAGACACCACCUAAAAAUGGAAGAUUAAUUCAGCCACAAAUUAGGACCUUUACUCCACCUCAGUCCCCCAAAUACAUCCUCAUGUGCACAGGAAGAGGUUCUAGUCCUCUGUAACAUAUCCCAAACAAAGCCAGCUGGACUCAGGCUUCUUUCUUAGGGCAAUAGAAGCAAGAGCUGCUAGAAGAAACAGGCCAGCAUGGAACAUCUGUUGGGACCUUUGUUAUCUCCAGUACUUAAAUAUUUGUUGAAGGAAUUAACUCCUGAGGAAGGAGCUUGGGAAAGAGCCGACAGGGAUUAUUGCACAGGUAAGGAAAAGAAAGGAAGUAUGCAAAGACAGCGUUGGGUGGGUUUUCUUGAUGAGCAUGACAGAAACCAAGUCAAACUUCUAUCAGUUUUCCAGGGGGAGGCCCUGGGAAAAGAGGUCUCUAUGGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-163.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -175.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 156.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((((...(((((..((((...((.((((((.....((.(((((..(((.....(((((..........)))))..((((..(.(((...))).)..))))...........(((..(((((.....(((((....((((.(((..((((.(((((....)))))..(((((...(((..((.....))..)))....)))))...........(((((..(((......(((((....)))))....))).)))))((((((.((.(((............))).))...))))))(((((((((((((((((((((((((((.....(((.((((.((.((((((((((((((.(......)))))))..))..)))).)))).))))))).....)))))))...........))))))))))))))))))))......((....)))))).)))..)))))))))........)))))..))).....)))..))))).))..)))))).))..)))).)))))....((((...)))).......((((((((((.....))))))))))))))).)))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((((((.{{(((((.,((((,,.{{.,{({,..,{{.((((((,...{,,.....(((((..,....}..)))))..|||}}}|.|||,||}|,}||,{{{...||,|,,,,,{.{||||||||||..,|.......,||},,.,,......(((((....)))))..(((((...(((..((.....))..)))....))))).,,,.,.,{,,{({{{..{{{......{({{{....)))))....))},))))}{((..{(((,((({,...(((((.......{,,.{((...(((((((((((((((((((((((((((.....(((.((((.(,,((((((((((((((.(,....,)))))))..))}.}))).)))},))))))).....)))))))..........,))))))))))))))))))))....})).,...)))))..}))}),)))..,)))..,}},,))},}|,||{.....,.)}}))))).))})}}}))}||||,|}}|{||,}}.....,|},,.,})},..,,..{(((((((((.....)))))))))}))))).)))).))).
Back