Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0319316
Sequence Length
592 nt
GC Content
0.4223
GGUUGUGGAGACGGGAUUUGUUGGUGGGUGUUCCUUGAGUGUAUGGAGCAGUCCUUUUGAUGGAGUCUUUAAUUUUGGGCGAAGUUUCUGGAAACCCAUCCUUUCACCAUCCCAAUUACUCUAAAGCUCGAGUCUCUGAAGCAUUUGAGAAAAAGCACAAAUUCAACAGAUAUUUAUCAAGUGUCUUCUCUGUGAUGUGGCUGAAGAUAGGAAUUUACAGCAUGGCAACAAAGAAUGAUACAACAUCUAACUGUACUAUGUGUGAAGUGCUACAAAAACAUAUGGCAAGCUCUGGAAUCAAGAAGUGAGGAGGCCAGAUGAGGAAACUGAGGGGUGAAGAGUUUAAGUCGUCUGCCCAAAACUAGCAGUGGGAGAGUGAUGCAGCCAGGAUUUAAACCCAGGUAGCCCAAAUACGGCAUCUACAAUCUAUCUCAAAUCUAUGGCAUCACAGAUGAGCUGGUGUCCACCUUUCCCUGAAGGAGUUGAAGGAGCUUUUAUAGAAGAAGUGAUAUCUGAACUGGACCUUAGAGAGUAAGUAAAAUUCUGCCAGAUAAAGAAUAUGUAAAAGUGUUAGUCCAGCCUGAGAUUUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-142.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -154.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 189.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((..((((((((.((((.(((((((((..........))))))..))).))))..)))))).....(((((((......(((((..((((.((.((((..((((...............(((((((((....)).)))))))....(((((...((((.((.(((........(((((((((.(((......((((.((((....)))).))))......))).)))).))))).(((......)))..))).)))))))))))...........((((...(((..............)))...))))))))..))))..)).)))).....(((((((((.(((((.....(((..(.....)..)))...))))..).))))))))))))))..)))))))..))...))))))))).....(((((((..((((((...))))....((((((...((((..(((.(((((((.....))))))).)))..)))).))))))....((((((((...(((((.......)))))...))......(((((......))))).))))))))..)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((..(((((((({{{((.(((((((((..,....,,.)))))).|))}.}}}}},})}))}.....(((((((......(((((.....{{(({({(({,,,(({{.....(((....{((,|||{,,||,.}}},|||}))....{{{{{...{{{.,{{,{{{........(((((((((.(((..{{{.((((.((((....)))).))))}},,,.})).)))).))))).{{{......))).,}}}|)})))}}}})}.......|||,|||{...{(({,............}}},..})))}}}),}}},,,|},}}}}}}..,,||||,{{||.|||||}}...|||..|,,,}))}.})),},)}}}.,)}))}},,,})))))}..)))))))..)),..)))))))))...,.(((((((..(((,{{.,,||||..{,((((({.{,{(((..(((.(((((((.....))))))).)))..))))})))))).}..{((((({{,,.{,{,|..,....|||||...,,....,,|||{{......}}}}}.))))))))..)))))))..
Back