Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0320053
Sequence Length
1025 nt
GC Content
0.3863
AACAGGAAUGCUGCUGGAAGAGCAAGAAUGAAAAUCAUCACAUAAAUUUGGGCCAUCCUGGUGAUGUCAGGAUCCACUUAAGAGCAGGAAGAUGCUGUCAGUAUUGAGAAAGAUGGCCCAGCAAGGAAAACAGCACAGCAUCAAGAUAAGGAUUCCUCUUUGAAGAAAGCUUCCUGCUGACUCAAAAGGAUUUUUCUUCUUCUGAACUCCUAUUAUGGGAAUGGAUGAAAUCACUUACAGAGCCACAGAAGGAAACAAAGCAAAGCCAGGAUCAUGAGUUGGAUUAUCUGGAGGCCUAGGCCAAUGGGGAGUUAUUGCUUGCAGUCACUGAUCAAGCAAAUAAACUUUUCCUUCUUUCUUAUGAAAUUUAUUUAAGAAGCUGAAAUUACUUAAAUGAUAAUGAGUUGUGAGAAAAGAAUUGUAGUAGAUAUUUGUUCUCUAUCCAAAUUGCACUGAGUGGGGAGGUGUACCCAUACCCCAGCUUCGAGAAUUGACUGAUAACAGUUCACACCUGCACUUCUCCAGAGAAUUGUCCUUGUCUGACCUGAGCACCUUGUUUAGUAAUGUCUGGUAGGCUAUGCUCCACCUUCCCUGGGCAGAUCCACUGGUCUAAGACAAACAACCCAACCCUCUAAUUUCUGGGAAGAAUCACCUCCGUGAUUAAUCUAAGCUCCAGAUCUCCCAGAGAAAUCAUGCUGAGGCUACAUUUGUGAAACUACAUUUUUAUCUAGCUUCUUCCUUUGCCCUUUCCUGCUGUCCUCACUUCCUUAUGAAUUUUUUUCUGAAAGAUCUUGAUUAAUAAAUUAUUUAAUCAAGAUCCCCCAGUCAUAAGUUCUGUGUUUUGGAAUAUAACCUAUACAAAAAUAAAUUAAUUGGUACUAGAUAAUGCUCCGCUAUGCAUCUAUUUCAAUGUCUAUUCUUUGGAAGUUCUGUCAUCACACAUCCCCAAGUUUUAGAUAAGGUUUUUAGCUAACAGCCAGGAAAAGAUUCAAUAAACUUAAAAGAAAAAGUGUUUUUAAAUGUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-255.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -277.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 216.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.((....((((((((.(((.(((((((..(((((......(((((((((((((((.((.(((.(((..(((......)))..))).))).)).)))).))...)))))))))((((((......((.(((..(((.(((((((((...((((((.((((.(((((((.(((.(((..((((((((((((..((((.(..........).)))).))).)))))).)))...)))...))).))))).....((((..((((((((........))))..)))).(((....)))...((((((((.((((((((((...)))..)))))))...)))))))).(((((((((((((...(((((((((((.......)).))))))))).......))))))).))))))..((((.(((.......))))))).....))))...((((((((..(((....))).))))).)))...((((((........))))))......))..)))).))))))...)))))))))))).))).)).)))))).(((......)))((((.((..((......(((.(((((.(((((...(((.((.(((.......((((.............))))...((((((....))))))..))).))..))))))))))))).))).....))..)).))))...)))))......)))))))))).)).))))))...))...)))))).................((((((((((((((...((((((((((((........))))))))))))..((((.((((.....))))..)))).....(((((................(((((...((((...(((........)))))))..)))))(((((...(((((......(((....))).....)))))...))))).)))))....(((...)))))))))))))))))....((((........))))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((.({.,,.((((((((.(({,(((((((..{{{((,,,,,.(((((((((((,(({.((.(((.(((..(((......)))..))).))).)).})}).))...))))))))){{{{({......((.(((,.({,{(((((((((...((((((.((({.(({((({.(((.(((..{((((({{{{{{{{{{{{,...{(({,...}))))..))).)))))).))}...)))...))).))))}....,{{,,..((((({((..,,....}}},.|)}}).(((....)))...((((((((,((((((((((...)))..))))))).,.))))))))}{((((((((((((...(((((((((,(.......}).))))))))).......)))))))))))))}.,((((,{((.,.....}}}}))),...,}}}},..((((((((.,(((....))).))))},))),}.{{{{((,,,,....)))))).....,))..)))).))))))...)))))))))))).))).)).}}))))}|{|.....,)}}((((.((..((......(((.(((((.(((({..,(((.((.(((.......{{{,.,,,.........})))...((((((....))))))..))).))..))))))))))))).))).....))..)).)))),,,))))}......)))))))))).))}})))))...))...))))))........,.....{{{((((((((((((((...((((((((((((........))))))))))))..((((.((((.....))))..}))).....,((({................,|{||...{((({,,(((........))))})),,}},,|(((((...(((((..{...(({....)}).,,..)))))...)))))}}}}},....(({...})))))))))))))))}.}},..{{,,,{|...,,,}.,,,,,,.......
Back