Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

HSALNT0353752

Sequence Length

974 nt

GC Content

0.4969

AGAGGACCUCCGCCAAGACCUCUCUCCGGGGUGGACCACGCACGCCCAGACCCCACAGCCGAAACUCAAAACACCAAGGAACAUGUGGCCACGACAUGGACUGCCCAUGCCAGCUUUCCCGACCUUCCUUCCAGUGGAAGGCCCGCGAAAGCGGGGACCACCUCCGGGCUAGCUCACCAGAACUGUGAAAGGACACUCACCACGCACCAGGCGACGAUGCCGGAACGCGGAAGUACGCGAGCCGGACUGCCCCUGGGCACGGAACUACACUACCCAGACUGCCACGGGGCGCGCAACUACCCUACCGUGGAUGCCCUGGAGCGAGGGACUACAACAUCCAGAAUGCUGCGAGGGGCGGGACCGCAGCAUCCAGGAGAAAUUGUGAAAAAUCAGAAAGUAAAAUCUAACUUUCGGGUCUAUGAGAAGGGUGGUCAGAUGGUGGAUUGGAAACAGUGUCAGCAUGACUCUCCCACUUGGAAAGACAAAAUGGUGAUCCUACCAUGCCCAUGCCGGAGUGUGCACAGGGACCGCUUCUCCAGCACUCAGCAGUCUGACUGGUUUCAUUUCCUCUCAUCUUACUGCUUGCUAGUAACUCUUCUUGGAUGGAAAAAAAGACAUGGUUGAAUAUGCAUCUUCCUCUAGUCCACUGCAUAUAACUCAUUGUUCUCAGCAAUCCAGGUUUACCUCUUCAAAUUUAUGCAGAACUGCAAAAAAUCAUUUUCUCUGAAGUAACUGCUUCUGUCAUUUUCAGCCAAUUUUGGCCUCAAAGCUAAAAAUACGUUGCUUGGUCAUUGCUAUUUGUCCUUCCUUCCAUGGGGCAGUAAGCUAAGACUUUUAGCCUAAUUCUCAUGAUGGAACAACUUCAAAGAAAAGGGAAAAACAAACUGCUUUAUUAAAAUGUACCAUUAUGGUCAGGACUUCAGUAGUGAGGAAGGCAGUGUGUGCGUAAUAAACAGGGAAGUAUAUGUGAACAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-287.57 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -306.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 277.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((.((((((((((((((.(((((((((((.(((((....((...............................))....)))))))))..(((((.....)))))..((((..((((.((((((.......))))))(((((....))))).........))))..))))..........((((........))))..(((.....)))......((((..((((......))))..))))...(((((((((((.(.................))))).))))).))(((.((((......)))).)))))))))).))))..............((.(((((.(((((((((..(((((...(((.((........(((....)))((((((........))))))((((.........(((.(((((..((.(((((((....)))).))).)))))))..)))..(((......))).((((((....))))))))))...)))))...)))...))..)))))))))))))).))((((((.(((..((........))..)))....)))))).............)))))).)))).........((((((..(((((((................)))))))))).))).)))))).......((.((.(((.((((.....(((((((.((((((......((.((((((.((((((...((.(((((((((.....((((....))))......((((((............((((...(((..(((((((.........)))))))..)))...)))))))))).........))))))))))))))))).))))))..))....(..((((((.........((.((((...)))))).......))))))..)....))))).).)))))))......)))).))).)).)).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

,(((({,.((((((((((((((.((((((((((,.((((({.{((({.....,,,,,,,,.................))....|||}||..,,.(((((.....))))).,{(((..((((.((((((.......))))))(((((....))))).........))))..)))|,,,.......||||.,{,....,,.},.,({.{{{{|||.,,...((((..((((......))))..))))..,{{{|{||{{|{.({...........}}.,..}))).})))))).||,.,,,,......)))).)))))))))).)))).{,,,,.....,..((.(((((.(((((((((..(({{{{{{(((.((......,.{{,....}},((((((........)))))){{((,,...,{..(((.(((((..((.(((((((....)))).))).))))))}..))).,|||...,,.),,.((((((....))))))}}}}...))))).,,)))...))..)))))))))))))).))((((((.{((..((........))..))),...)))))),,.,}}}......)))))).))))......,.,{(({{,..,||||{,.,,,,,,,,.,.....||||||||}|,,,|{|||},,,}},.|,{,.((,{{|.,,,......(((((((.,{((((......{(,{{,,,,,((((((..,((,{{{{{{{{,...,,{{{{.,,,||||......||}|}},....,,,|||,{(((...(({..,((((((.........))))))),.})),|,}}}},}}))).......,{|||||||,|||,,}}}}.}|}},|{|,.....,..,||,||||.......||},|||,,,))),)),.,}}}}}),}))))},..,))))).}.))))))},,,}}.,))}.}}},})})).....