Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0353755
Sequence Length
1568 nt
GC Content
0.4394
GUGGCCACGACAUGGACUGCCCAUGCCAGCUUUCCCGACCUUCCUUCCAGUGGAAGGCCCGCGAAAGCGGGGACCACCUCCGGGCUAGCUCACCAGAACUGUGAAAGGACACUCACCACGCACCAGGCGACGAUGCCGGAACGCGGAAGUACGCGAGCCGGACUGCCCCUGGGCACGGAACUACACUACCCAGACUGCCACGGGGCGCGCAACUACCCUACCGUGGAUGCCCUGGAGCGAGGGACUACAACAUCCAGAAUGCUGCGAGGGGCGGGACCGCAGCAUCCAGGAGAAAUUGUGAAAAAUCAGAAAGUAAAAUCUAACUUUCGGGUCUAUGAGAAGGGUGGUCAGAUGGUGGAUUGGAAACAGUGUCAGCAUGACUCUCCCACUUGGAAAGACAAAAUGGGCUUAAUUAUUAGAUAAGGAUACGUUUCCAACUGAAGGUGGCAACGUUAUGCUGGAAGAACAUGUCAGGAAGACCACAAAAUUUCAUGACUGUACUUGCUACACUUUCAGCAGAAGAGUUAUACAUAUUUUCAAUUCAACAAAGAUUAAGCCAAAAAGAAUUCUUAGAACAUUCCCACUCUUCUUUGGCACAUCAAAAGGCAACAAAUGUCAUUUUCUCCCAUGUUUUUAUGUGCAGUUUAGAACAAAGACCAAUUAUCUAUGCAGCUGUCCACAGUGGAUAAAACAAAAAGCAUACAUUUGGUCCAGAGUUAAGUCACCUGGGUUGGGCCCAUCCAAGGAAGUUUGAUGUUUCUACUCUCAUGAAAAGUACCAAUGGCACUGCACAGUGAUUAUCUUAGAUAUUAAGGAUAAACACAAAUUUCUCCUUAAAUUUCCAUUUAUUGGAAAUGAUUGGAGGGAGGGAACUUCUCCCUCACCUCCACACUGCCUCUUUUCCAACUCUUCUUCCAACACAAAAUAGUUUAAACAGCAAGCACUUAGAGAGCUUUUAGCCUUGCUUGUUGAUUACAAGGCCCAAGUUAGUGUAUGGUUUGCCCAUCGGAGGAAAGCUAAAACAUGGGCCUUCAUGGGUAUUAAAAUUGAAGAAACCUUUUCCAGCAUUUUUUCUAUUUUCUUUAAAGUAACAACCUAUGGACUUCCCCAUCUGACAUUUUCGAGUGAUCCCACUGUGUGAAUGAAGGACUACUUCAGGGUUUGAGGGCAAAGCUGAAAUCUUAGCAACUUACCAGUGAGCAAAGGUAGAACCCAGAGCCCAUCUCUCCUUUUCCAGGCUGCUGAGUAAAGUCUGGCUCAAUCAACCUAUCAAUGAAGCAGUGCUUACAACAUUCUCCAAGACCACCCAAAACCCAAACUGGAAAUGAAUCAUGACUAAUCUGACUCAUUUUGGCUCACACAGUGCCCUUCCAAUUUGUAUUUACCUUUACCACCCAGGACCUGACCUUGGACAUGUGUACCAGGAUGUAAGGCAAUAAACCUAUUCACAAUUCCAAAAGGGCCUGGUCCUCUAUGAAGAUUUCCUGAAGGCUACUUACUUUCUCUACUCAUUAAAAUUUUUGCUUAACUUCAAAUUUCUGAAAUAUACCAUAUGUGAAAAAUUUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-433.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -464.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 349.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((....(((((.....)))))..((((..((((.((((((.......))))))(((((....))))).........))))..))))..........((((........))))..(((.(((((........((((..((((......))))..))))...(((((((((((.(.................))))).))))).))(((.((((......)))).)))))))).)))..(((........)))...((((((((.(........))))))))).((((((((((((.(((......((((((........))))))(((((.((..(((((...(((((((((.(((((((((((.(((((...........((((.(((......)))..))))((((.........)))))))))))))))))((((((((((((......))).(.(((.(((.((((((((..........)))).))))))).))).)..))))))))).(((((((((.......................(((...((((((((((...................)))).))))))..)))...(((((.(((((((...........((((((((.(((((.((.((((..............)))).)).))((((((...))))))..)))))))))))))))))).(((((.((......)))))))((((......))))(((((((((.((((.......((((....(((.((...)).))).....)))).((((((........)))))))))))))))))))......(((((((.....)))))))...((((((((((((.....)))))).))))))...))))).......)))))))))...(((........)))(((.(((((((((.....((.(((...)))))))))))))).))).((((((((.(((......((((((..((......)).)))))).))).))))))))(((((((.......(((((((((......................))))))))).......)))))))....)))))))))))).)))))..)))))))((((((((((.(((((.....)))))((((((..(((....(((((....))))).........(((((((..(((((.....((((.....))))......(((((((.........)))))))..........)))))..........))))))).................))).))))))....(.(((((((.(((.((....))))).))))))).).))))))))))...)))))))))(((........)))...(((((.(((....(((((..((((....(((.(((......)))..)))...))))..)))))..))))))))...(((....))).))))))..))))))................(((((.(((((((..............................))))))).))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((..{.(((((.....))))).,{(((..((((.((((((.......))))))(((((....))))).........))))..)))|{,,.......||||..{,,..,|{.{{.(((.(((((........((((..((((......))))..))))..,(((((,,((((.({...........}}....)))).,)))))).(((.((((......)))).)))))))).))).}||,.,,,,...|||.{.((((((((.(........))))))))).|{|||,,..|||||,.......((((((........))))))(((({.{(,.((((({{.(((((((((.((({(((((((,(((((,.,,{,{,...((((.(((......}}}..}}}}(({,.{,....,.,,,}}}}}}))))))),((((((((((({......))),(,(((.(((.(((({(((,.........}))).))))))).))).),.))))))))).{((((((({...............,.......||,...(((({{{(((.......{,..........}})),))))))..||..,,{((((.....|||,....,.....||||||||.{({(({((....,.....((((((...,.(((((...((((({...}))))).........))))).},)))))).{(,{{...,,||||||{{{{{,},}}},})}}||,||,,}}}}|,,,,.},},,,,{,...,,,.,,..})},))))}}}}{{|.,(((({,.,,..,{{||||,||,,,,...,}}.}}}}}},(((((((.....)))))))...((((((((((((.....)))))).)))))),,}))},,..,,,,,))}}}}}}}...,,,........}},,{{.(((((((((....,((.(((...)))))))))))))).}},.,(((((((.{{{.,{,,.((((({.(({....,.)).}))))).,)),)))))))|(((((((.......(((((((((......................))))))))).......))))))),...)))))))))))).}}}}}..}})}))}((((((((((.(((((.....)))))((((((..(((....(((((....))))).........((((((({{((.{({....,((,.....})))}}}},.,{{{|||,,,,.},..}}}}}}||||,.............}}},}},,,))))}).....,,,...,},...))).))))))....(.(((((((.(((.((....))))).))))))).).)))))))))),,,}}}}},,..{{{........}}}.,.,,((((((.,.(((((((..((((....(((.{{{......,},..)))...))))..))))..,))},}.)))))}....,.}}.,,})))}..))))))................{((((.(((((((.....{(({......}))}........,,.))))))).))))}.
Back