Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0365090
Sequence Length
4584 nt
GC Content
0.4797
GUUCAACAUUAUGCUUUUAAGGAUUAGAUAGAAGAGGUCUCCUACCUAUUCCUUUUAGCACCUUGGCUGCAAAGCUCCAGAGGAAGAUUUGGGGGAAAGAGUGAGCCUAUGACCAGGAAGACAGAGCCCAGCCCUGCUAUAGUCCAGUUGCUCUCCCACAGGGCACCUGGAGCUUAGGGGGUUAGGAUAUUUCAGUGCUGCCUAUCAUAUGUAGAAUAAAGGGUGGUUCAGAUAGAGACAAUGAAAUUAAUAUGGCAGAAAUUCAUGUGUUAAGUGGAACUUCUUAGUGGGCACUUCAUUUAAGAGAGCUAAAAAAGAGCUCUUUGGCUAGAUAAGCCCUUCCCAUCUCACUUUUGGUCAGGCUGCAACCACAGAAAAGAAAACAUUGAAAACAACACCCAUCUUCUGAGAUGGGAUGCUAUCUUGGAGAUGAGGUCUAAAACUAGGACUGGUGAGUGGUUGUGUUUCUGCCUUUCCUAGCUUUGAUCCCACUAUUCCCUGUCUUUGUACUCCCUCUCCUUCUCCUCUUUCCAGCCGCCCCCAUUUGUAUAAAUAGUCAAUCUAGUUUUUUUUUUUAAUUCAAGAGGCAAUCUUUGCACCAAUGUUAGGCUUGUUUAUACAGUCCCUGUCUCUAAAGCAAAUAGCAAACUGUGCAUCCUCUCCUACUGACUUUGGCCAGCAGGGAAACAAGCUUGGUCUCUUCUCUGCCAGGGUACCACAGGGACACACGCCAAGGUAACCUGCGUGUGAUGCCAGUACUUCUGAAACUAAGAAAAGAAGAAUACUUUGGGUUGGAGAAUUUAAAGGAAUGGUGGACAAAGGUUCAGGGCUGAAGUUUCAAGCAGCAGAAUUUCCCGACUUAAAUUUGAGGUGACCAAGAGUAUUCCCGCCAGCAGAGUGCUUCUUUCUUCUCUUUUCUGUUUCCUACAGGUACAGUCCCUGGAACCCACCUUGCCAGCCUUUUCCUUCUCCAUCAAGGCAGAGGCAUUUGGUGGGUGGGGAGGGUCCUGAGGUGCUCUGGCCACAGGUGCCAUCUGUGUCUCCUACUUGUGACCAAAGUGAACCACGGAGGUGUGGUCCAGGGGAAUCUCUAUCUUCUGCCCAUGGGCCUCCUCACUUCAGCAGGGAGAUGUCAUCAGCAAAGUCAUCAUGCUGCUGGCGCAGGCAGCGGAGGCAGCGCCACUGACACACCAUGAGGCAGAGUGGCAGCAUGAAGAGGGCGCAGAUGGCAGCCAUGACAUAGGCUAUGGUCAUGAGGGUUGACUCAUCUGUCUGUGGAAUGUUGUAGCCACAGUCUUCCAUGUCCAAGGUGACAAAAGGGCCUUCCACCGCUGCCGUCCUGAACUCAUCGUGCACUGGGGAGAGGGCAAAUGUGAAUGGACAGCUCUCAUUGUCAUAGAGGAGUUAACAAAAAGAACUUCCUGAUAGUGAGGCCUUGAAAUUAGCCCAUGCAGAAGUUAUCUAAUCUCCUUCCCAGGAGAUAUUUAGGAGCAGGCUGGGAAGCCAGCACCAGGUAGAGGCCUGUCUCCCUUCCCAAGUCACUGGGAGCAGCAGCCCUUCCUUGUAUACCCAGCUGGUAGGAGUGAUAACUAAAAGUCAGUAGUUCUGAGUUGACCAAAAGCCACCCCCUUGACCAAAAGCCAAAUCUAGUAAACUUAACUUUCUGCUGCUGAAAUCCAACUGCAAAACCCUGCCACCUUUCUGAAGUAGCAUUCAGCCUCACCAUGUGGCAGCUGACAGGGUCACUAUAGACUCAGUCUGCUACCCUUGCAUCAAGAGCUUCCCAAGGUACCCAGGUAACUCUUGCUGCUCUGGGUUUCCAACAGAGGUUACCAAUCCAGGCAGUGGUCAUUAUGGCAGGCAGUACAAAAAAAGGACGAGCAUUGACACUAGCUUUUGCACAACUGUUGACUUGGGUUUGAGGCAACUGUUACUACCCUCCCCUAAACUGACAGGGACCCAGGUAUACUAACUGUUGUUUGACAAGGAAAAUAUGGAGAGACUGACCCCAAACCCUCAGCCCUGGCACUCUCACCAUGGCAAGCGCUGACAGCAAAGCCAAUUCGUUUUCGGGCCCGAUCAAAGACAACGUAGAAGCCCUCCAUGAUAACAGCUCCCAUAACAGUGCCCGUGGAUGACUGUGAGAUGGCAAACUUGUAACAGUCGUCUUGGGACGUGGCCACAUCUUCCACUGGCCGCAGGUAUUGCUAGGGGUAAGCAAUCACAGGGUGAGUGUCUUCCUCACUCUCCUUCACCCCAUCUCUGCCUUGUAGGCAUCUAUGCCCUUCCCUUUACCAUCCCUGAGCUCUAACGGGUUUUCUGAGACCCCUUUACUGCUGGACACUACUCAUCUGUUUUGUCUUCCAAGUUCUGGCAAGCCAUACCUGCUCACUGUCUCCCAGUGUGUACUUUUAAGAGAGAUCCCCCUGACUCAGGCUGGGACAUACCUGCGGAAGGAUGGUGAUGCGGAAGGACUGGUUGGUAACCUCACCCAUUAGGUAGAGUGAGAUGACUGGGAAAAUGUUCCAAGGGGUGGUGCCUGCUUGCCAGCACACCAGCUGCUCUCCUAGCCAGAAACCAUCAGGGAACUUCUCCGUCUGUGUUGGCAAGAAGGGGAUAACAAUGAGGAAAAGCCUCUUUAUCAUCUCGCCCCUCCCAUGUUCAGAUACAUUAACUGGGCCCUUCAUUUGCUUUUCCAGUGAAAUAUCUAAAGUGGGGAGGGGUAAACCAACCAGAGGAUUACAGGAAGAGAGAGGGAGUGUGAUGUCAAACUUUUGUACCGGGGGAUUGUGUGAUGAGCAAAGUGACAGCCAUAAAGGGGAAGAGUUUUUUUUUUUUUUUUGAAACAGUGUCUCACUCUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCAAUCAUGGCUCACCGCAACCUCCACCGUCCUGAGUUAAAGUGAUUCUCCUGUCUCAGCCCCCUGAGUAGCUAGGAUUACAGGCGUGCGCCACCACACCCAGCUAAUUUUUGUACUUUUAGUAGAGAUGGGAUUUCACCCUGUUGGUCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUAGUGAUCUGCCCACCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCACGCCUGGCUAGGGGAAGAGUGUUUUAAGAGCUCUGAGUAGAAGGGUCUAAGUGCAGACAUCUUGGCUGUUGCUGAAGAAUGUGACUCUCACCGCCUCCCUCUGACACUGUACCAUCUCUUUUACCCCCAUCCUUAGUCCACUCACGGAGGAGGCUGCCUUGAUGGAUUUGACUGCAGCUUCAAACACUUUCUUGGGCAAACGAAGAUGGAGUAUUAGCUCUGUCACCCAGGCUGGAGUACAGUGGCGUGAUCUCGGCUCACUCUAACCUCUGCCUCCUGGAUUCAAACCAUUCUUUUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGUGCCUGCCACCACGCCUGGCUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGACCAGGCUGGUCUCGAAUUUCUGACCUCAAAUGAUCUGCCCCCGCCUUGGCCUCCCAGAGUGCUGGGAUUACAGCCACGCCCGGCCGCUUUUAACUUUUCUUAGUACAUUUAUAUCUAUUCUAAUUUAACAUACAUAAGAAUCUAGGGAAGGAAGACAUAAAUGAUUUAGUUACCUUUUAUUGAGUACUGCCAACCACAGAGAUAAACACUUUACACAUUAUCUCUGAUAUUCUGAGAAAGUUGUUUUUACCUGUUUUGCAGAUAAGGAAACUGAGACACAGAAUAGUAACUGGCCUAAGGGUACAUAGCUAGUACAAAUCAGAGCUAGAUUCAGAUCUGGGUCUUCCUGACUCCAAAGACAAGACUCUUCAUUCUAUCACCCUGUCUCACAAAAGACUUGCCCAAGGCUACGAAGCAAGGCAGUGACUAGAGUCCAGACAUCAGAACUAGUUCCAUGUUUUUUUUUUCACUACCAGUCCCUAGGCCCCAAACCGCAGAUCCUGCUGUGUGACCAUUAAGCCCCUGACUGUUCUAGGCUCAACUUCCAACCCUUUCUGCAGGUCCUAUUACCUCUGCCUCAUCCUCCCAACAUGAUAACCAGAGUCUUCCUUCACAUUGUACUGCCUACCCCCUUAUGUUCCCAGGCUCUCCCUUGGUUUUCUUACCUCCUUGCAGUCCAUUUUCAGAUCCUGUCCAUUGAUCUCCACCCGCACAAUGAUCACCUCAUAAUACCACUCCCGCCGGAUGGGUGUAUACCAGAGACUGCCUGUGUACAGCGAGUGGUCGAUACCUCCAAUGAUCUAGGGAAAAAAAGAGGCAGGUACCCGUGUCCUGGCACAGAAGGAGAGUGAGUCCCCCAAGGACCAAGCAAUAAGAUCAGUGAUUUCUUGGGGUGGCAAGGUCUUCUACAGGCUACCCUUUUCAUCUUCCUGCUUCUAAACAAAUCAUACCCAAAGUGAUUUCUAGUUUCUUAAAUGUGUUCAGGAGAAAAGACUUUCCGGGAUUUUUAAUUAUUUGUUUCAGAAUCAUACAGCCCUUGAUAUAAAGUUAUUUAAAUCUAAACUGCCACAAUAAAUGUUGAAUGAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1453.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1538.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 1262.69
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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