Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
HSALNT0371027
Sequence Length
544 nt
GC Content
0.5129
GGCCGACUCAAAUUCAAAGCAUUUUGUAUAUAUAACUGUUUUCUUUUUUUGCUUUUCUGCUGCAUGUCUUUUUCGUGGGGGGUGAUCCUCUGCAGAUCCCCCCAUUUGCGGACCCGCCAUGUGGAGGAGGCAUUUGGGGGGCUCAGAAGGAAAUUAGCUCGGCUUCCAUACCUAUAAGGACUGCCUAACUUUUAAACUCCCGGCACUCAAAGAUGUGGACACACACACGUACAGGAAAUACAGCCAGACCAGAGCCUUUGCAGUCCGCAGCUGACCGGAAGACGUUGCCUUUCAUUCAUUCAUUCUGCCCGCCUCUGUGGACUCCUUUACUAGGCGACCAGCCCUGAAACAGAAGUUGGACAUUUUUUAAAGGUUCUUGCGCUCGGCAAGGGGAGCAGAUAGAUGCUCAGGAGCGAAAGACGCAGAGAAUUGGAUCUGGCGCCUCCUAACGCAGCCCGCACAGGAGCGAAGGAGAGUGUGACGAUCCCCCUGAUGCGGCUGAGAUGUUCUGAAAUGAAGACGUUGGCUCUCAUCCCCAGCCUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-170.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -180.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 144.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((......((((((............................))))))(((((((.((.((((...((((((((((..(((((((.((..(((((((..(((...(((((...)))).)...)))..)))))))))))).)))).........(((.(((..........)))..)))..........))))))............((((....))))))))...)))).)).))).)))).((((((.(((.(((.((((((((((.((.((((....((((((.................(((((..(((((....))))).))))).(((((.(((...)))..))))).........)))))))))).)).))))).(((((((((......)))))....(((.....)))........((((((.(((((((((..(((...((.....)).))).))))).)))).).)))))))))..))))))))))).)))))).......)).)))))))................
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((....,..{{,,,,,.}}})...........((((((,(((,..((.((((.(((((((,{{{{,...({,((((((..(((((((.((..(((((((..(((...(((((...)))).)...)))..))))))))))))}}))).....,...(((.(((.{,.......)))..)))..........}}}}}}.)),.,.,,}}}|(((....,,|,},||,..,{{.....,.((((((((({,..(((((({((((((((.{(..(((((({....,..,.........,,.,}}}|.,||,,.}}))))}}}((({{{..|||.{.(((((.(((...)))..))))).}.}}}..)))))),{(({,({{{{.}}.,,,,(((((......)))))..}})))..})),))))))..}))).)))))),,(((((..(((...((.....)).))).))))).))}},,.,})))})))}))))))).)))).))...)))).))))))))))))}................
Back